中華絨螯蟹微孢子蟲的原位雜交檢測探針及試劑盒的制作方法
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001] 本發(fā)明涉及中華絨螯蟹微孢子蟲的原位雜交檢測探針及檢測用試劑盒。
【背景技術(shù)】
[0002] 中華絨螯蟹（Eriocheir sinensis)俗稱河蟹，是我國特有的水產(chǎn)養(yǎng)殖珍品，但隨 著養(yǎng)殖集約化和規(guī)?；l(fā)展，各種病害已經(jīng)成為危害養(yǎng)蟹業(yè)的重要難題。近幾年，在江蘇省 興化市、鹽城市鹽都區(qū)和泗洪縣等地的河蟹主養(yǎng)區(qū)廣泛流行微孢子病，該疫情給當(dāng)?shù)氐暮?蟹養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)造成了巨大損失。主要癥狀為河蟹附肢長期空癟，雖能繼續(xù)蛻殼，但生長緩慢， 解剖見肝胰臟顏色由金黃色逐漸變淺，直至灰白色，部分還出現(xiàn)"拉黃"（排泄肝胰腺）的癥 狀。至今為止，關(guān)于該病的診斷仍然是主要采用解剖觀察的方法，具有明顯的局限性，因此 開發(fā)出更加高效、準(zhǔn)確和便捷的診斷方法將有非常顯著的現(xiàn)實(shí)意義和廣闊的應(yīng)用前景。
[0003] 原位雜交技術(shù)是利用帶有標(biāo)記物的特征性核酸序列作為探針，與樣品中互補(bǔ)的核 酸序列雜交，然后通過抗原-抗體反應(yīng)和酶-底物的化學(xué)顯色反應(yīng)將檢測信號(hào)逐級(jí)擴(kuò)大，顯 示檢測結(jié)果。原位雜交假陽性率低，從直觀性、準(zhǔn)確性和靈敏度綜合考慮是一種其它任何方 法都無法替代的檢測方法，且至今未見有關(guān)中華絨螯蟹微孢子蟲的原位雜交檢測方法的報(bào) 道。

【發(fā)明內(nèi)容】

[0004] 本發(fā)明的目的在于提供一種用于高靈敏度、高可信度同時(shí)又非常直觀的中華絨螯 蟹微孢子蟲檢測的探針，并提供檢測試劑盒。
[0005] 本發(fā)明根據(jù)中華絨螯蟹微孢子蟲18S SSU rDNA(HE584635)設(shè)計(jì)一對(duì)特異性引物， PCR擴(kuò)增，以地高辛進(jìn)行標(biāo)記，制備特異性檢測中華絨螯蟹微孢子蟲的探針，所述探針如SEQ ID NO. 1所示，該探針的引物序列如SEQ ID NO. 2和SEQ ID NO. 3所示。
[0006] 本發(fā)明公開了中華絨螯蟹微孢子蟲的原位雜交檢測探針，序列如SEQ ID NO. 1所 示。該序列以地高辛進(jìn)行標(biāo)記可制備成檢測中華絨螯蟹微孢子蟲的特異性探針，用于檢測 試劑盒中。
[0007] 本發(fā)明還公開了 SEQ ID NO. 1所示序列作為中華絨螯蟹微孢子蟲的原位雜交檢測 探針的應(yīng)用。
[0008] 本發(fā)明公開了上述中華絨螯蟹微孢子蟲的原位雜交檢測探針在制備中華絨螯蟹 微孢子蟲的原位雜交檢測試劑盒中的應(yīng)用。
[0009] 此外，本發(fā)明還提供一種用于中華絨螯蟹微孢子蟲的原位雜交檢測試劑盒，該試 劑盒包括原位雜交檢測試劑，還含有由上述中華絨螯蟹微孢子蟲的原位雜交檢測探針制備 的特異性探針。具體地，該試劑盒由多個(gè)試劑瓶組成，所述的試劑瓶包括含特異性探針A液 (探針濃度100 μ g/ml)，所述特異性探針是指經(jīng)地高辛進(jìn)行標(biāo)記的SEQ ID NO. 1，含蛋白酶 K (10 μ g/ml)的B液，用于促進(jìn)探針結(jié)合的C液（Dig Easy Hyb Granules, Roche)，封閉非 特異性蛋白位點(diǎn)的D液（10X ,Blocking solution，Roche)，含有堿性磷酸酶標(biāo)記地高辛抗 體的E液，用于顯色的F液（50XNBT/BCIP)。
[0010] 本發(fā)明具有如下有益效果：
[0011] (1)能直觀地將微孢子蟲與其引起的病理變化結(jié)合起來；
[0012] (2)在高效、準(zhǔn)確檢測微孢子蟲的同時(shí)可根據(jù)樣本切片分析感染率和感染強(qiáng)度；
[0013] (3)由于探針的雜交是特異的，且信號(hào)經(jīng)過了逐級(jí)放大，所以較常規(guī)的染色檢測靈 敏、精確；
[0014] (4)本發(fā)明中，顯色后的切片可以長期保存。
【附圖說明】
[0015] 圖1，健康中華絨螯蟹陰性對(duì)照；
[0016] 圖2,輕度微孢子蟲感染的中華絨螯蟹原位雜交檢測結(jié)果；
[0017] 圖3,重度微孢子蟲感染的中華絨螯蟹原位雜交檢測結(jié)果。
[0018] 圖中標(biāo)尺=100μηι。
【具體實(shí)施方式】
[0019] 下列實(shí)驗(yàn)及操作實(shí)例是進(jìn)一步對(duì)本發(fā)明的說明，不應(yīng)該當(dāng)作對(duì)本發(fā)明的限制。以 下實(shí)施例中除特別說明外，均為本領(lǐng)域內(nèi)的常規(guī)試劑、實(shí)驗(yàn)方法和操作步驟。
[0020] 實(shí)施例1 :
[0021] 中華絨螯蟹樣品：
[0022] 發(fā)病中華絨螯蟹于2014年8月取自江蘇省內(nèi)發(fā)生嚴(yán)重死亡的養(yǎng)殖場，平均重量 91. 2g(樣本量η = 30)。健康中華絨螯蟹于2014年9月，取自南京中華絨螯蟹養(yǎng)殖場，平 均重量94. 3g(樣本量η = 24)。健康中華絨螯蟹通過常規(guī)光鏡、電鏡觀察和PCR檢測，確定 無微孢子蟲感染，作為陰性對(duì)照；發(fā)病中華絨螯蟹經(jīng)光鏡、電鏡觀察和PCR檢測確定是有微 孢子蟲感染后，作為陽性對(duì)照。
[0023] 樣品固定及切片制備：
[0024] (1)固定：取中華絨螯蟹易感染組織肝胰腺于含0.1%DEPC的4%多聚甲 醛（1000ml蒸餾水中加 Na2HPO4. 12H20 36g，多聚甲醛干粉40g，加熱攪拌溶解后加 NaH2PO4. 2H20 3g，pH 7. 0 ;趁熱加 DEPC至終濃度0· 1 % )固定2小時(shí)后，用PBS洗滌3次， 每次30min，然后脫水、透明、石蠟包埋、切片；
[0025] (2)切片（需同時(shí)做陽性和陰性對(duì)照）：將組織切成厚度為7-10 μm的組織切片， 并將烘烤后的切片保存于4°C冰箱。
[0026] 探針合成：
[0027] (1)收集微孢子蟲感染的中華絨螯蟹肝胰腺，利用基因組DNA提取試劑盒 (QIAGEN，51304)進(jìn)行模板DNA的提取，具體步驟參照試劑盒的說明書。
[0028] (2)用于合成探針的DNA片段是根據(jù)⑴中提取的模板，由下面一對(duì)引物擴(kuò)增出來 的，引物序列如下：
[0029] W3F :5'-CTGTGAGGCTATTGTTGGGC-3'（SEQ ID NO. 2)
[0030] W3R :5,-TACTGTGCTCCCTGTCCATT-3'（SEQ ID NO. 3)
[0031] 按照以下步驟將上述引物擴(kuò)增出的目的片段（序列信息如SEQ ID NO. 1所示）經(jīng) 過膠回收后用地高辛標(biāo)記過夜即為檢測中華絨螯蟹微孢子蟲的特異性核苷酸探針：
[0032] 具體制備方法為：
[0033] (I)PCR反應(yīng)體系如下表：
[0035] (2) PCR擴(kuò)增程序如下：首先95 °C變性4min ;緊接著40個(gè)循環(huán)的95 °C Imin， 58°C 30s，72°C Imin ;最后是 72°C延伸 5min，4°C保存。
[0036] (3)探針標(biāo)記步驟如下：1 %瓊脂糖凝膠電泳分析后，切膠回收DNA，Nanodrop 2000紫外分光光度計(jì)對(duì)濃度進(jìn)行定量，取I μ g凝膠回收的DNA加入無菌蒸餾水，至總體積 16 μ 1，煮沸變性IOmin后立刻置于冰上，加入4 μ I DNA地高辛標(biāo)記液，37°C孵育24h，最后 加入2μ1 0. 2M EDTA(pH 8. 5)終止反應(yīng)，該產(chǎn)物即為標(biāo)記好的探針，-20°C保存。
[0037] 原位雜交檢測：
[0038] 將上述特異性探針與制備好的切片進(jìn)行原位雜交，所述的特異性探針與樣本目的 片段結(jié)合，并進(jìn)一步結(jié)合堿性磷酸酶標(biāo)記的抗地高辛Fab片段，通過堿性磷酸酶顯色系統(tǒng) 進(jìn)行信號(hào)放大檢測。本發(fā)明提供的試劑盒由多種試劑組成，包括用于含特異性探針的A液 (探針濃度100 μ g/ml)，含蛋白酶Κ(10 μ g/ml)的B液，用于促進(jìn)探針結(jié)合的C液（Dig Easy Hyb Granules, Roche)，封閉非特異性蛋白位點(diǎn)的 D 液（10X ,Blocking solution，Roche)， 含有堿性磷酸酶標(biāo)記地高辛抗體的E液，用于顯色的F液（50XNBT/BCIP)。
[0039] 具體如下：
[0040] (1)將組織切片進(jìn)行脫蠟：二甲苯5minX2,二甲苯+無水乙醇（I :l)5min ;
[0041] (2)酒精梯度清洗：無水乙醇101^1^2,95%、90%、80%、70%的乙醇各511^11，最 后 PBS IOmin ;
[0042] (3)Triton X-10010min，PBS 10min，37 cC 下 B 液（蛋白酶 K 50μg/ml)清 洗1511^11，0.2%甘氨酸511^11，？85(似(：188，1((：10.28，似 2冊(cè)04 1.448，腿2?04 0 . 248，用 DEPC-H2O配置1L，調(diào)整pH為7. 4)5minX2,4%多聚甲醛滴片固定5min ;
[0043] (4)PBS 5minX 2,再將切片放入55°C去離子甲酰胺和IX檸檬酸三鈉 -NaCl緩沖 液（SSC，1000ml蒸餾水中加氯化鈉8. 8g，檸檬酸三鈉 4. 4g)的等量混合液中浸泡30min ;
[0044] (5)預(yù)雜交：在干的雜交盒底部加20 %甘油20ml以保持濕度，按每張20 μ 1加 A 液，恒溫箱38°C預(yù)雜交lh，吸取多余液體，不洗；
[0045] (6)雜交：用C液稀釋A液至50 μ g/ml，每張切片加20 μ 1，蓋上蓋玻片，恒溫箱 42°C，雜交過夜。
[0046] (7)雜交后洗滌：揭去蓋玻片，37°C 2XSSC洗滌2次，每次5min;0.5XSSC洗滌 15min ;0· 2 X SSC 洗滌 15min ;
[0047] (8)滴加稀釋后的D液（使用前10000rpm/min離心5min，吸取上層液體稀釋10 倍），37°C 30min ;
[0048] (9)按照I :2000抗體效價(jià)，滴加 E液，37°C 60min，PBS洗4次，每次5min ;
[0049] (10)將玻片放入檢測緩沖液（0· IM Tris-HCl、0.1 M NaCl，pH 9. 0)平衡 2min ;
[0050] (11)顯色：將玻片放到用檢測顯色液稀釋后的F液中避光孵育顯色（40 μ I F液， 2ml檢測緩沖液）顯微鏡下控制顯色；
[0051] (12)顯色完全后，PBS清洗IOmin ;二甲苯脫色，封片，觀察。
[0052] 結(jié)果觀察：
[0053] 地高辛標(biāo)記的特異性探針與細(xì)胞內(nèi)寄生的微孢子蟲特異性地結(jié)合，經(jīng)堿性磷酸酶 染色后呈深藍(lán)紫色。所檢測的健康中華絨螯蟹無特異性信號(hào)（圖1)，輕度感染微孢子蟲的 中華絨螯蟹陽性信號(hào)點(diǎn)較少，零星分散（圖2)，重度感染微孢子蟲的中華絨螯蟹信號(hào)聚集， 集中于肝胰腺的上皮中（圖3)。
【主權(quán)項(xiàng)】
1. 中華絨螯蟹微孢子蟲的原位雜交檢測探針，序列如SEQIDNO. 1所示 2. SEQIDNO. 1所示序列作為中華絨螯蟹微孢子蟲的原位雜交檢測探針的應(yīng)用。3. 權(quán)利要求1所述中華絨螯蟹微孢子蟲的原位雜交檢測探針在制備中華絨螯蟹微孢 子蟲的原位雜交檢測試劑盒中的應(yīng)用。4. 一種中華絨螯蟹微孢子蟲的原位雜交檢測試劑盒，包括原位雜交檢測試劑，其特征 在于，還含有由權(quán)利要求1所述中華絨螯蟹微孢子蟲的原位雜交檢測探針制備的特異性探 針。5. 根據(jù)權(quán)利要求4所述的中華絨螯蟹微孢子蟲的原位雜交檢測試劑盒，其特征在于， 包括： (1) 含特異性探針的A液，所述特異性探針是指地高辛標(biāo)記的權(quán)利要求1所述檢測探 針； (2) 含蛋白酶K的B液， (3) 促進(jìn)探針結(jié)合的C液：DigEasyHybGranules,Roche， (4) 封閉非特異性蛋白位點(diǎn)的D液：10X，Blockingsolution，Roche， (5) 含有堿性磷酸酶標(biāo)記地高辛抗體的E液， (6) 用于顯色的F液：50XNBT/BCIP。
【專利摘要】本發(fā)明公開了中華絨螯蟹微孢子蟲的原位雜交檢測探針及試劑盒。所述探針的序列如SEQ？ID？NO.1所示。所述探針用地高辛標(biāo)記，與中華絨螯蟹組織切片中的微孢子蟲18S小亞單位核糖體DNA(18S？SSU？rDNA)雜交結(jié)合后，經(jīng)堿性磷酸酶檢測系統(tǒng)顯色，在顯微鏡下觀察即可判斷微孢子蟲的感染。本發(fā)明還提供了含有該探針的試劑盒，該試劑盒特異性好，操作簡便，能直觀地將病原檢測與病理變化結(jié)合起來；在高效、準(zhǔn)確檢測螺原體的同時(shí)，由樣本切片上分析感染率和感染強(qiáng)度；由于探針與18S？SSU？rDNA的雜交是特異的，且信號(hào)經(jīng)過了逐級(jí)放大，所以較常規(guī)的染色觀察檢測靈敏、精確；而且檢測結(jié)果雜交顯色后的切片可長期保存。
【IPC分類】C12Q1/68, C12N15/11
【公開號(hào)】CN105177165
【申請(qǐng)?zhí)枴?br>【發(fā)明人】丁正峰, 薛暉, 劉洪巖, 孫夢(mèng)玲, 趙彥華
【申請(qǐng)人】江蘇省淡水水產(chǎn)研究所
【公開日】2015年12月23日
【申請(qǐng)日】2015年10月26日