本發(fā)明涉及生物醫(yī)學(xué)、農(nóng)業(yè)、食品衛(wèi)生等檢驗(yàn)檢疫系統(tǒng),具體地說是一種基于高效液滴微反應(yīng)器的絕對(duì)定量數(shù)字核酸分析系統(tǒng),主要用于檢測(cè)核酸的分子結(jié)構(gòu),從而分析生物的屬性,屬于生物、醫(yī)學(xué)檢測(cè)領(lǐng)域。
背景技術(shù):
核酸是生物體內(nèi)的高分子化合物。包括脫氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)和核糖核酸(ribonucleic acid,RNA)兩大類。核酸不僅是基本的遺傳物質(zhì),而且在蛋白質(zhì)的生物合成上也占重要位置,因而在生長(zhǎng)、遺傳、變異等一系列重大生命現(xiàn)象中起決定性的作用。核酸分析技術(shù)的優(yōu)越性在于它的高靈敏度和特異性,通過核酸擴(kuò)增技術(shù)以及雜交技術(shù)對(duì)核酸進(jìn)行檢測(cè)分析,從而可實(shí)現(xiàn)但不限于,細(xì)菌、病毒等微生物檢測(cè),腫瘤等疾病診斷,產(chǎn)前無損DNA診斷,遺傳疾病的風(fēng)險(xiǎn)預(yù)警,以及藥物篩選、精準(zhǔn)醫(yī)療等生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域應(yīng)用。
核酸分析的前提是核酸擴(kuò)增,即聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Polymerase Chain Reaction,PCR),稱PCR擴(kuò)增,在體外通過特定的酶促進(jìn)反應(yīng),進(jìn)行一段特定DNA或RNA片段擴(kuò)增,從而獲取大量的目標(biāo)DNA片段。核酸分析方法經(jīng)歷了三個(gè)發(fā)展階段。第一階段就是普通的PCR擴(kuò)增儀,擴(kuò)增后的模板DNA經(jīng)凝膠電泳分析,定性地檢測(cè)目標(biāo)片段的有無,而不能對(duì)起始模板進(jìn)行定量檢測(cè)。第二個(gè)階段,在PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán),利用熒光信號(hào)積累實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)整個(gè)PCR進(jìn)程,最后通過擴(kuò)增產(chǎn)物達(dá)到閾值時(shí)所經(jīng)歷的循環(huán)次數(shù)和標(biāo)準(zhǔn)曲線來定量起始模板的濃度。實(shí)時(shí)熒光定量PCR采用校準(zhǔn)品和樣品之間的比較來進(jìn)行相對(duì)定量檢測(cè),校準(zhǔn)品和樣品間由于背景不同而引入偏差,對(duì)于低拷貝數(shù)的靶DNA難以檢測(cè)。同時(shí)DNA提取過程中引入的雜質(zhì)可能對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)生抑制作用。第三個(gè)階段代表是美國Bio-Rad公司的QX200液滴式數(shù)字PCR,其特征在于,首先對(duì)樣品進(jìn)行微液滴化處理,將含有核酸分子的反應(yīng)體系分散為成千上萬個(gè)納升級(jí)的液滴,其中每個(gè)微滴不含或含有一個(gè)待檢核酸靶分子,每個(gè)微滴都作為一個(gè)獨(dú)立的PCR反應(yīng)器,經(jīng)PCR擴(kuò)增后,有熒光信號(hào)的液滴為1,沒有熒光信號(hào)的液滴0,最終根據(jù)泊松分布原理以及陽性液滴的比例,分析軟件可計(jì)算給出待檢靶分子的濃度或拷貝數(shù)。液滴式數(shù)字PCR具有極高的擴(kuò)增效率和特異性,檢測(cè)靈敏度可達(dá)到0.001%。通過計(jì)數(shù)分析檢測(cè)結(jié)果,不需要標(biāo)準(zhǔn)曲線,可實(shí)現(xiàn)絕對(duì)定量。QX200液滴式數(shù)字PCR的樣品檢測(cè)需要三個(gè)儀器分三步來完成,首先在液滴產(chǎn)生儀器中產(chǎn)生液滴,用PCR管將液滴收集后轉(zhuǎn)移到PCR擴(kuò)增儀中進(jìn)行擴(kuò)增,擴(kuò)增結(jié)束后再將擴(kuò)增產(chǎn)物轉(zhuǎn)移到數(shù)據(jù)讀取分析儀中進(jìn)行結(jié)果讀取,分析過程繁瑣、復(fù)雜、周期長(zhǎng),不適合進(jìn)行快速的核酸分析與檢測(cè)。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
針對(duì)現(xiàn)有技術(shù)的上述不足之處,本發(fā)明的目的在于提供一種基于高效液滴微反應(yīng)器的絕對(duì)定量數(shù)字核酸分析系統(tǒng)。
本發(fā)明的目的是通過以下技術(shù)方案來實(shí)現(xiàn)的:
本發(fā)明包括共聚焦熒光圖像采集系統(tǒng),用于向微流控芯片進(jìn)行熒光激發(fā),并采集激發(fā)光照區(qū)域中的被測(cè)樣品的圖像;
微流控芯片,放置在溫度循環(huán)加熱系統(tǒng)上;
溫度循環(huán)加熱系統(tǒng),安裝在電動(dòng)加載平臺(tái)上,用于在控制器的控制下,對(duì)微流控芯片進(jìn)行循環(huán)加熱;
電動(dòng)加載平臺(tái),用于承載微流控芯片及溫度循環(huán)加熱系統(tǒng),進(jìn)而帶動(dòng)微流控芯片進(jìn)行水平直線運(yùn)動(dòng)、或垂直直線運(yùn)動(dòng)、或曲線運(yùn)動(dòng);
自動(dòng)進(jìn)樣裝置,用于樣品注入,實(shí)現(xiàn)微流控芯片上的液滴產(chǎn)生并使產(chǎn)生的液滴進(jìn)入到微反應(yīng)器中;
控制器,連接并控制共聚焦熒光圖像采集系統(tǒng)、溫度循環(huán)加熱系統(tǒng)、電動(dòng)加載平臺(tái)和自動(dòng)進(jìn)樣裝置的工作;
計(jì)算機(jī),連接控制器,用于將采集到的微流控芯片上的PCR微反應(yīng)器的圖像進(jìn)行濾波、邊緣檢測(cè)、直方圖計(jì)算、確定檢出限、二值化處理、計(jì)算明場(chǎng)下所有液滴數(shù)量、計(jì)算熒光場(chǎng)下液滴數(shù)量、分析計(jì)算絕對(duì)模板數(shù)及樣品濃度;
其中:所述共聚焦熒光圖像采集系統(tǒng)位于微流控芯片的上方,激發(fā)微流控芯片上PCR微反應(yīng)器區(qū)域,并采集光照區(qū)域的圖像,所述共聚焦熒光圖像采集系統(tǒng)包括圖像傳感器、光學(xué)鏡組和濾光片,還包括:
激發(fā)光源,用于在控制器的控制下發(fā)出光源,照射到二向色鏡上;
二向色鏡,用于反射所述激發(fā)光源發(fā)出的光源,使反射光照射到微流控芯片上的任一個(gè)PCR微反應(yīng)器區(qū)域,激發(fā)陽性模板發(fā)出熒光,發(fā)出的熒光經(jīng)所述二向色鏡透射后通過所述濾光片和光學(xué)鏡組至圖像傳感器,實(shí)現(xiàn)成像;
所述自動(dòng)進(jìn)樣裝置包括動(dòng)力源、執(zhí)行機(jī)構(gòu)及通氣裝置,其中執(zhí)行機(jī)構(gòu)連接于動(dòng)力源的輸出端,所述執(zhí)行機(jī)構(gòu)的執(zhí)行端連接有通氣裝置;所述通氣裝置包括通氣管、常閉電磁閥、三通、負(fù)壓真空泵及真空吸盤,該三通連接于所述執(zhí)行機(jī)構(gòu)的執(zhí)行端,一端連接所述真空吸盤,另一端通過通氣管與所述負(fù)壓真空泵相連,第三端通過通氣管與大氣相連,并在與大氣相連的通氣管上設(shè)有所述常閉電磁閥;所述動(dòng)力源、負(fù)壓真空泵及常閉電磁閥分別與所述控制器電連接;
所述微流控芯片包括多個(gè)液滴生成器及多個(gè)PCR微反應(yīng)器,每個(gè)PCR微反應(yīng)器具有各自獨(dú)立的液滴生成器、各自的進(jìn)樣口及油相進(jìn)樣口,多個(gè)所述PCR微反應(yīng)器共用一個(gè)出口,所述出口用于連接自動(dòng)進(jìn)樣裝置,通過所述自動(dòng)進(jìn)樣裝置真空抽氣生成液滴并使其進(jìn)入到各PCR微反應(yīng)器中;每個(gè)所述PCR微反應(yīng)器分別通過通道與出口相連,在每個(gè)所述通道上均設(shè)有對(duì)液體倒流產(chǎn)生緩沖作用的緩沖區(qū);所述通氣裝置的真空吸盤隨執(zhí)行機(jī)構(gòu)移動(dòng)罩在所述微流控芯片的出口上,通過所述負(fù)壓真空泵將進(jìn)樣口中的樣品抽入到PCR微反應(yīng)器中進(jìn)行反應(yīng)、檢測(cè);所述真空吸盤的內(nèi)徑大于微流控芯片的出口的外徑,該真空吸盤落到微流控芯片的出口上時(shí)將所述出口罩住,且不與所述出口接觸,并與微流控芯片密封吸附;
所述執(zhí)行機(jī)構(gòu)為滑塊導(dǎo)軌執(zhí)行機(jī)構(gòu),包括垂直導(dǎo)軌、滑塊A、水平導(dǎo)軌、位置傳感器、聯(lián)動(dòng)桿、滑塊B及氣缸B,所述動(dòng)力源為氣缸A,該氣缸A的輸出端連接有滑塊A,所述滑塊A與安裝在氣缸A上的垂直導(dǎo)軌滑動(dòng)連接,所述水平導(dǎo)軌安裝在滑塊A上,在該水平導(dǎo)軌上設(shè)有氣缸B,所述氣缸B的輸出端連接有與水平導(dǎo)軌滑動(dòng)連接的滑塊B,所述垂直導(dǎo)軌及水平導(dǎo)軌上分別安裝有與控制器電連接的位置傳感器;所述三通通過聯(lián)動(dòng)桿連接于該滑塊B上;
所述執(zhí)行機(jī)構(gòu)為絲杠絲母執(zhí)行機(jī)構(gòu),包括絲杠A、絲母A、電機(jī)B、絲母B、絲杠B、位置傳感器及聯(lián)動(dòng)桿,所述動(dòng)力源為電機(jī)A,該電機(jī)A的輸出端連接有絲杠A,所述絲母A與絲杠A螺紋連接,所述電機(jī)B安裝在該絲母A上,輸出端連接有所述絲杠B,所述絲母B螺紋連接于絲杠B上,所述絲杠A及絲杠B上分別安裝有與控制器電連接的位置傳感器;所述三通通過聯(lián)動(dòng)桿連接于該絲母B上;
所述溫度循環(huán)加熱系統(tǒng)的一個(gè)循環(huán)加熱過程包括三個(gè)溫度段:
1)變性階段持續(xù)t1秒;
2)退火階段持續(xù)t2秒;
3)延伸階段持續(xù)t3秒;
或,所述溫度循環(huán)加熱系統(tǒng)僅包括一個(gè)恒溫溫度段;
或,所述溫度循環(huán)加熱系統(tǒng)僅包括兩個(gè)變溫的溫度段;
各階段溫度值和持續(xù)時(shí)間在計(jì)算機(jī)上設(shè)置;
所述電動(dòng)加載平臺(tái)為二維、三維、多維或旋轉(zhuǎn)運(yùn)動(dòng)平臺(tái);
所述控制器包括
微處理器,用于控制循環(huán)加熱驅(qū)動(dòng)模塊、電動(dòng)平臺(tái)驅(qū)動(dòng)模塊、光源驅(qū)動(dòng)模塊、真空泵驅(qū)動(dòng)模塊、進(jìn)樣定位驅(qū)動(dòng)模塊和通信模塊;
通信模塊,連接微處理器,用于控制器與計(jì)算機(jī)之間的交互通信;
光源驅(qū)動(dòng)模塊,與微處理器相連,用于連接共聚焦熒光圖像采集系統(tǒng),并驅(qū)動(dòng)共聚焦熒光圖像采集系統(tǒng)中的激發(fā)光源發(fā)出激發(fā)光;
循環(huán)加熱驅(qū)動(dòng)模塊,與微處理器相連,用于控制溫度循環(huán)加熱系統(tǒng)循環(huán)加熱的各段溫度、控制各溫度段的加熱時(shí)間及循環(huán)次數(shù);
電動(dòng)平臺(tái)驅(qū)動(dòng)模塊,與微處理器相連,用于控制電動(dòng)加載平臺(tái)在水平、垂直方向上的直線運(yùn)動(dòng),或沿順時(shí)針或逆時(shí)針方向轉(zhuǎn)動(dòng);
真空泵驅(qū)動(dòng)模塊,與微處理器相連,用于控制驅(qū)動(dòng)真空泵動(dòng)作,為自動(dòng)進(jìn)樣裝置產(chǎn)生負(fù)壓驅(qū)動(dòng);
進(jìn)樣定位驅(qū)動(dòng)模塊,與微處理器相連,用于控制自動(dòng)進(jìn)樣裝置的真空吸盤與微流控芯片的出口對(duì)接,實(shí)現(xiàn)進(jìn)樣。
本發(fā)明的優(yōu)點(diǎn)與積極效果為:
相對(duì)于已有的絕對(duì)定量核酸分析系統(tǒng),本發(fā)明的優(yōu)勢(shì)在于大大簡(jiǎn)化了絕對(duì)定量核酸分析過程的復(fù)雜性、提高了絕對(duì)定量核酸分析過程的檢測(cè)靈敏度和時(shí)效性,大大降低了絕對(duì)定量核酸分析的樣品使用量,實(shí)現(xiàn)高通量檢測(cè)。本發(fā)明優(yōu)勢(shì)特征在于微液滴的產(chǎn)生、PCR擴(kuò)增反應(yīng)在同一片微流控芯片上完成,該微流控芯片既完成液滴產(chǎn)生功能又完成PCR擴(kuò)增(微反應(yīng)器)功能;在PCR擴(kuò)增之后由專用的圖像采集裝置對(duì)液滴進(jìn)行光學(xué)采樣,之后再由高效計(jì)算軟件進(jìn)行核酸分析。本發(fā)明系統(tǒng)可實(shí)現(xiàn)皮升級(jí)的微量樣品檢測(cè),檢測(cè)極限低至一個(gè)模板(一個(gè)檢測(cè)分子)。分條闡述如下:
1.反應(yīng)體系在微流控芯片上的微反應(yīng)器內(nèi)完成,樣品極其微量,實(shí)現(xiàn)皮升級(jí)檢測(cè)。
2.快速檢測(cè)。前處理只需粗提,無需培養(yǎng)或增菌過程,全部過程2~5小時(shí)完成。
3.極高的檢測(cè)靈敏度,檢測(cè)極限低至一個(gè)目標(biāo)模板。
4.芯片上實(shí)現(xiàn)微反應(yīng),容易增加反應(yīng)單元數(shù)量,實(shí)現(xiàn)高通量。
5.可在同一個(gè)芯片上實(shí)現(xiàn)多個(gè)樣品的并行檢測(cè),大大提高檢測(cè)效率。
6.液滴產(chǎn)生、PCR擴(kuò)增及數(shù)據(jù)檢測(cè)一鍵完成,不需要人工干預(yù)。
7.可實(shí)現(xiàn)智能控制的一鍵式進(jìn)樣、核酸擴(kuò)增及熒光檢測(cè),具有高效的核酸計(jì)算分析軟件及友好的人機(jī)界面。
8.相對(duì)于現(xiàn)有的正壓、負(fù)壓、電動(dòng)、重力等各種進(jìn)樣方法,本發(fā)明的自動(dòng)進(jìn)樣裝置優(yōu)勢(shì)在于將樣品注入到微流控芯片的進(jìn)樣口后不再需要人工干預(yù),整個(gè)進(jìn)樣過程由控制器控制一鍵式完成,完全智能化。
9.自動(dòng)進(jìn)樣裝置采用負(fù)壓進(jìn)樣,只要有一個(gè)出口,無論有幾個(gè)進(jìn)樣口,都只需一個(gè)負(fù)壓真空泵即可完成。
10.自動(dòng)進(jìn)樣裝置適應(yīng)性廣,適合各種通道類型的微流控芯片進(jìn)樣。
附圖說明
圖1為本發(fā)明的系統(tǒng)構(gòu)成框圖;
圖2為本發(fā)明微流控芯片形式之一(8個(gè)PCR微反應(yīng)器);
圖3為本發(fā)明微流控芯片形式之二(4個(gè)PCR微反應(yīng)器);
圖4為系統(tǒng)控制器框圖;
圖5為核酸分析系統(tǒng)功能結(jié)構(gòu)圖;
圖6為本發(fā)明自動(dòng)進(jìn)樣裝置的結(jié)構(gòu)示意圖;
圖7為本發(fā)明自動(dòng)進(jìn)樣裝置另一種執(zhí)行機(jī)構(gòu)的結(jié)構(gòu)示意圖;
圖8為本發(fā)明自動(dòng)進(jìn)樣裝置中通氣裝置的結(jié)構(gòu)示意圖;
其中:1為圖像傳感器,2為光學(xué)鏡組,3為濾光片,4為二向色鏡,5為激發(fā)光源,6為微流控芯片,601為PCR微反應(yīng)器,602為進(jìn)樣口,603為液滴生成器,604為出口,605為通道,606為緩沖區(qū),607為油相進(jìn)樣口,7為溫度循環(huán)加熱系統(tǒng),8為電動(dòng)加載平臺(tái),9為自動(dòng)進(jìn)樣裝置,10為控制器,11為計(jì)算機(jī),12為動(dòng)力源,13為執(zhí)行機(jī)構(gòu),1301為垂直導(dǎo)軌,1302為水平導(dǎo)軌,1303為滑塊A,1304為位置傳感器,1305為聯(lián)動(dòng)桿,1306為滑塊B,1307為絲杠A,1308為絲母A,1309為電機(jī)B,1310為絲母B,1311為絲杠B,1312為氣缸B,14為通氣裝置,1401為通氣管,1402為常閉電磁閥,1403為三通,1404為負(fù)壓真空泵,1405為真空吸盤。
具體實(shí)施方式
下面結(jié)合附圖對(duì)本發(fā)明作進(jìn)一步詳述。
本發(fā)明為可實(shí)現(xiàn)智能控制的一鍵式進(jìn)樣、核酸擴(kuò)增、熒光檢測(cè)核酸分析系統(tǒng),如圖1所示,包括共聚焦熒光圖像采集系統(tǒng)、微流控芯片6、溫度循環(huán)加熱系統(tǒng)7、電動(dòng)加載平臺(tái)8、自動(dòng)進(jìn)樣裝置9、控制器10及計(jì)算機(jī)11,其中共聚焦熒光圖像采集系統(tǒng)包括圖像傳感器1、光學(xué)鏡組2和激發(fā)光源5,圖像傳感器1包括但不限于CCD相機(jī)、CMOS相機(jī)等圖像采集裝置,光學(xué)鏡組2包括但不限于光學(xué)鏡頭、二向色鏡4、濾光片3等部件,激發(fā)光源5包括但不限于LED光源、激光光源、鹵素?zé)艄庠吹取?/p>
如圖1所示,加完樣品后的微流控芯片6放到電動(dòng)加載平臺(tái)8上,置于電動(dòng)加載平臺(tái)8上的還有溫度循環(huán)加熱系統(tǒng)7,該溫度循環(huán)加熱系統(tǒng)7位于微流控芯片6下方。自動(dòng)進(jìn)樣裝置9經(jīng)控制器10控制對(duì)準(zhǔn)微流控芯片6上的出口,負(fù)壓抽真空產(chǎn)生液滴并使之進(jìn)入到微反應(yīng)器中。啟動(dòng)溫度循環(huán)加熱系統(tǒng)7開始對(duì)PCR微反應(yīng)器進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增結(jié)束后,打開激發(fā)光源5,激發(fā)光經(jīng)二向色鏡4反射后照射在微反應(yīng)器區(qū)域,激發(fā)目標(biāo)模板發(fā)出熒光,所發(fā)出熒光透射過二向色鏡4,經(jīng)濾光片3濾光、光學(xué)鏡組2聚焦后照射到圖像傳感器1上,從而可采集被測(cè)樣品圖像。所采集圖像上傳到計(jì)算機(jī)后,經(jīng)系統(tǒng)分析軟件對(duì)圖像進(jìn)行濾波、邊緣檢測(cè)、直方圖計(jì)算、確定檢出限、二值化處理、計(jì)算明場(chǎng)下所有液滴數(shù)量、計(jì)算熒光場(chǎng)下液滴數(shù)量、分析計(jì)算絕對(duì)模板數(shù)及檢測(cè)樣品濃度等。
微流控芯片6包括多個(gè)液滴生成器603和多個(gè)均勻分布的PCR微反應(yīng)器601,每個(gè)PCR微反應(yīng)器601具有各自獨(dú)立的液滴生成器603、各自的進(jìn)樣口602及油相進(jìn)樣口607,每個(gè)液滴生成器603分別與進(jìn)樣口602及油相進(jìn)樣口607相連通,可同時(shí)檢測(cè)多個(gè)不同的樣品,或同一樣品中的多種不同目標(biāo)模板;所有的液滴生成器可以共用一個(gè)或多個(gè)油相及表面活性劑進(jìn)口,如果采用多個(gè)油相及表面活性劑進(jìn)口,這些進(jìn)口也是相互連通的。每個(gè)PCR微反應(yīng)器601內(nèi)有柱狀凸起或橫亙的攔截壩,將PCR反應(yīng)器601分割成數(shù)萬個(gè)到數(shù)十萬個(gè)小室,用于固定液滴。多個(gè)PCR微反應(yīng)器601共用一個(gè)出口604,出口604用于連接自動(dòng)進(jìn)樣裝置9中的負(fù)壓真空泵,通過自動(dòng)進(jìn)樣裝置9真空抽氣生成液滴并使其進(jìn)入到各PCR微反應(yīng)器601中;每個(gè)PCR微反應(yīng)器601分別通過通道605與出口604相連,在每個(gè)通道605上均設(shè)有緩沖區(qū)606,緩沖區(qū)606為蛇形(但不限于蛇形,包括一段直通道或儲(chǔ)液式圓孔),當(dāng)負(fù)壓真空泵撤離時(shí)對(duì)液體的倒流產(chǎn)生一個(gè)緩沖作用。本發(fā)明的PCR微反應(yīng)器還兼作為檢測(cè)區(qū),樣品充滿PCR微反應(yīng)器601后檢測(cè)傳感器即反饋信號(hào)給控制器10,控制器10立即停止負(fù)壓真空泵1404工作,停止進(jìn)樣。
本發(fā)明的PCR微反應(yīng)器可為多個(gè),如圖2中所示的八個(gè)PCR微反應(yīng)器,或如圖3中所示的四個(gè)PCR微反應(yīng)器,但不限于八個(gè)或四個(gè)。如圖2所示,具有八個(gè)圓形PCR微反應(yīng)器601,采集完成一個(gè)PCR微反應(yīng)器圖像后,圖1中的電動(dòng)加載平臺(tái)8順時(shí)針轉(zhuǎn)動(dòng)45°角,開始采集第二個(gè)PCR微反應(yīng)器圖像;以此類推,完成全部八個(gè)PCR微反應(yīng)器的圖像采集和處理。另外一種情況,電動(dòng)加載平臺(tái)8可逆時(shí)針旋轉(zhuǎn)完成PCR微反應(yīng)器圖像的采集。還可以電動(dòng)加載平臺(tái)8順時(shí)針旋轉(zhuǎn)完成一部分PCR微反應(yīng)器圖像采集,然后逆時(shí)針旋轉(zhuǎn)完成另一部分PCR微反應(yīng)器圖像采集。如圖3所示,具有四個(gè)PCR微反應(yīng)器601,采集完成一個(gè)PCR微反應(yīng)器圖像后,圖1中的電動(dòng)加載平臺(tái)8順時(shí)針轉(zhuǎn)動(dòng)90°角,開始采集第二個(gè)PCR微反應(yīng)器圖像;以此類推,完成全部四個(gè)PCR微反應(yīng)器的圖像采集和處理。另外一種情況,電動(dòng)加載平臺(tái)8可逆時(shí)針旋轉(zhuǎn)完成PCR微反應(yīng)器圖像的采集。還可以電動(dòng)加載平臺(tái)8順時(shí)針旋轉(zhuǎn)完成一部分PCR微反應(yīng)器圖像采集,然后逆時(shí)針旋轉(zhuǎn)完成另一部分PCR微反應(yīng)器圖像采集。
另外一種情況,如果微反應(yīng)器非如圖2或圖3所示的環(huán)形排列,而采用縱橫排列,則電動(dòng)加載平臺(tái)8按照平行或垂直方向移動(dòng),完成所有圖像的采集。
如圖6所示,自動(dòng)取樣裝置9包括動(dòng)力源12、執(zhí)行機(jī)構(gòu)13及通氣裝置14,其中執(zhí)行機(jī)構(gòu)13連接于動(dòng)力源12的輸出端,在執(zhí)行機(jī)構(gòu)的執(zhí)行端連接有通氣裝置14。
如圖8所示,通氣裝置14包括通氣管1401、常閉電磁閥1402、三通1403、負(fù)壓真空泵1404及真空吸盤1405,該三通1403的頂部連接于執(zhí)行機(jī)構(gòu)的執(zhí)行端,一端連接真空吸盤1405,另一端通過通氣管1401與負(fù)壓真空泵1404相連,第三端通過通氣管1401與大氣相連,并在與大氣相連的通氣管1401上設(shè)有常閉電磁閥1402。真空吸盤1405的內(nèi)徑大于微流控芯片6的出口604的外徑,當(dāng)真空吸盤1405落到出口604上的時(shí)候,保證真空吸盤1405將出口604罩住,并且不與出口604接觸,從而避免了交叉污染。本發(fā)明的真空吸盤1405為具有彈性的硅膠材質(zhì),在真空吸盤1405罩在出口604上時(shí)與微流控芯片6密封吸附,可以起到很好的密封作用,保證足夠的真空度實(shí)現(xiàn)負(fù)壓進(jìn)樣。
如圖6所示,執(zhí)行機(jī)構(gòu)13為滑塊導(dǎo)軌執(zhí)行機(jī)構(gòu),包括垂直導(dǎo)軌1301、滑塊A1303、水平導(dǎo)軌1302、滑塊B1306、位置傳感器1304、聯(lián)動(dòng)桿1305及氣缸B1312,動(dòng)力源12為氣缸A,該氣缸A的輸出端連接有滑塊A1303,滑塊A1303與安裝在氣缸A上的垂直導(dǎo)軌1301滑動(dòng)連接;水平導(dǎo)軌1302安裝在滑塊A1303上,在該水平導(dǎo)軌1302上設(shè)有氣缸B1312,氣缸B1312的輸出端連接有與水平導(dǎo)軌1302滑動(dòng)連接的滑塊B1306,三通1403的頂部通過聯(lián)動(dòng)桿1305連接于該滑塊B1306上。在垂直導(dǎo)軌1301及水平導(dǎo)軌1302上分別安裝有與控制器10電連接的位置傳感器1304。
本發(fā)明的執(zhí)行機(jī)構(gòu)13不限于導(dǎo)軌運(yùn)動(dòng),也可如圖7所示,執(zhí)行機(jī)構(gòu)13為絲杠絲母執(zhí)行機(jī)構(gòu),包括絲杠A1307、絲母A1308、電機(jī)B1309、絲母B1310、位置傳感器1304、聯(lián)動(dòng)桿1305及絲杠B1311,動(dòng)力源12為電機(jī)A,該電機(jī)A的輸出端連接有絲杠A1307,絲母A1308與絲杠A1307螺紋連接,電機(jī)B1309安裝在該絲母A1308上,輸出端連接有絲杠B1311,絲母B1310螺紋連接于絲杠B1311上,三通1403的頂部通過聯(lián)動(dòng)桿1305連接于該絲母B1310上。在絲杠A1307及絲杠B1311上分別安裝有與控制器10電連接的位置傳感器1304。
或者,執(zhí)行機(jī)構(gòu)還可以為旋轉(zhuǎn)運(yùn)動(dòng),帶動(dòng)通氣裝置達(dá)到微流控芯片6上的出口604處。
本發(fā)明的動(dòng)力源12、負(fù)壓真空泵1404、常閉電磁閥1402及位置傳感器1304分別與控制器10電連接。
以執(zhí)行機(jī)構(gòu)13為滑塊導(dǎo)軌執(zhí)行機(jī)構(gòu)為例,以嵌入式微處理器為核心的控制器10(本發(fā)明的控制器10為現(xiàn)有技術(shù))控制整個(gè)自動(dòng)進(jìn)樣裝置9。當(dāng)控制器10發(fā)出進(jìn)樣指令后,氣缸A工作,帶動(dòng)滑塊A1303在垂直導(dǎo)軌1301上移動(dòng),水平導(dǎo)軌1302隨滑塊A1303同步移動(dòng),水平導(dǎo)軌1302上的氣缸B1312帶動(dòng)滑塊B1306在水平導(dǎo)軌1302上移動(dòng)(可先垂直移動(dòng)后水平移動(dòng),或者先水平移動(dòng)后垂直移動(dòng)),通過聯(lián)動(dòng)桿1305和通氣裝置14相連,通過控制執(zhí)行機(jī)構(gòu)13的水平或垂直運(yùn)動(dòng)使通氣裝置14到達(dá)指定位置,位置傳感器1304反饋停止運(yùn)動(dòng)信號(hào)給控制器10,控制器10控制執(zhí)行機(jī)構(gòu)13停止移動(dòng),并使通氣裝置14上的真空吸盤1405剛好落在出口604處,并將出口604罩住??刂破?0啟動(dòng)通氣裝置14中的負(fù)壓真空泵1404工作,在負(fù)壓的作用下,真空吸盤1405緊緊吸住微流控芯片6,并開始抽吸使樣品池603中的樣品從進(jìn)樣口602進(jìn)入到PCR微反應(yīng)器601,并在PCR微反應(yīng)器601的位置進(jìn)行檢測(cè);當(dāng)樣品全部充滿PCR微反應(yīng)器601,PCR微反應(yīng)器601區(qū)域的檢測(cè)傳感器檢測(cè)進(jìn)樣結(jié)束信號(hào)并反饋給控制器10提示進(jìn)樣完成,控制器10發(fā)出指令停止負(fù)壓真空泵1404工作,并打開通氣裝置14的常閉電磁閥1402使空氣進(jìn)入到三通1403內(nèi)釋放真空吸盤1405,使真空吸盤1405離開微流控芯片6。隨后,控制器10控制執(zhí)行機(jī)構(gòu)13帶動(dòng)通氣裝置14離開出口604,回到起始位置,完成一次進(jìn)樣過程。
溫度循環(huán)加熱系統(tǒng)7,溫控裝置通過某種熱交換器件,包括但不限于電加熱器件(如半導(dǎo)體制冷片、電阻絲、電鍍膜)、輻射加熱器(如紅外加熱器)、介質(zhì)換熱器(介質(zhì)包括但不限于水、空氣、油、乙二醇、乙醇等載冷劑)等,實(shí)現(xiàn)循環(huán)加熱,一個(gè)溫度循環(huán)過程包括三個(gè)溫度段:1)變性階段持續(xù)t1秒,2)退火階段持續(xù)t2秒,3)延伸階段持續(xù)t3秒,各階段溫度值和持續(xù)時(shí)間可在控制計(jì)算機(jī)軟件或儀器控制面板上設(shè)置。根據(jù)實(shí)際樣品的檢測(cè)要求,溫度控制還可設(shè)置為一個(gè)恒溫溫度段,或只有兩個(gè)變溫的溫度段。
電動(dòng)加載平臺(tái)8,用于承載微流控芯片6和溫度循環(huán)加熱裝置7,可以為二維、三維、多維或旋轉(zhuǎn)運(yùn)動(dòng)平臺(tái),帶動(dòng)微流控芯片6進(jìn)行水平或垂直直線運(yùn)動(dòng),或?yàn)槿我馇€運(yùn)動(dòng),如此可以實(shí)現(xiàn)圖像采集裝置分時(shí)多區(qū)圖像采集。
控制器10是核酸分析系統(tǒng)的核心部件,它控制核酸分析系統(tǒng)按照既定的程序工作。控制器10主要包括微處理器、通信模塊、光源驅(qū)動(dòng)模塊、循環(huán)加熱驅(qū)動(dòng)模塊、電動(dòng)平臺(tái)驅(qū)動(dòng)模塊、真空泵驅(qū)動(dòng)模塊、進(jìn)樣定位驅(qū)動(dòng)模塊,如圖4所示。微處理器是平臺(tái)控制器的核心部件,負(fù)責(zé)外圍接口電路、循環(huán)加熱驅(qū)動(dòng)模塊、運(yùn)動(dòng)平臺(tái)驅(qū)動(dòng)模塊、光源驅(qū)動(dòng)模塊、真空泵驅(qū)動(dòng)模塊、進(jìn)樣定位驅(qū)動(dòng)模塊、通信模塊的控制與通信工作。通信模塊通過一定媒體介質(zhì)與計(jì)算機(jī)11進(jìn)行交互通信,通信方式包括但不限于有線通信、無線通信、紅外通信等,媒體介質(zhì)包括但不限于空氣、光纖、線纜、電磁波、紅外線等。光源驅(qū)動(dòng)模塊驅(qū)動(dòng)激發(fā)光源5發(fā)出光源,經(jīng)二向色鏡4反射后照射到微流控芯片6的PCR微反應(yīng)器601區(qū)域,激發(fā)陽性模板發(fā)出熒光。負(fù)壓真空泵驅(qū)動(dòng)模塊,控制驅(qū)動(dòng)真空泵動(dòng)作,為自動(dòng)進(jìn)樣裝置產(chǎn)生負(fù)壓驅(qū)動(dòng)。進(jìn)樣定位驅(qū)動(dòng)模塊,精確控制自動(dòng)進(jìn)樣裝置9中的真空吸盤1405與出口604對(duì)接,實(shí)現(xiàn)進(jìn)樣。循環(huán)加熱驅(qū)動(dòng)模塊,精確控制循環(huán)加熱的各段溫度、控制各溫度段的加熱時(shí)間及循環(huán)次數(shù)。運(yùn)動(dòng)平臺(tái)驅(qū)動(dòng)模塊,精確控制電動(dòng)加載平臺(tái)8在水平、垂直方向上的直線運(yùn)動(dòng),或沿順時(shí)針或逆時(shí)針方向轉(zhuǎn)動(dòng)。
計(jì)算機(jī)11將采集到的液滴圖像進(jìn)行濾波、邊緣檢測(cè)、直方圖計(jì)算、確定檢出限、二值化處理、計(jì)算明場(chǎng)下所有液滴數(shù)量、計(jì)算熒光場(chǎng)下液滴數(shù)量、分析計(jì)算絕對(duì)模板數(shù)及檢測(cè)樣品濃度等。核酸分析系統(tǒng)功能結(jié)構(gòu)框圖如圖5所示。