本發(fā)明屬于動(dòng)物檢疫技術(shù)領(lǐng)域,具體涉及一種雞毒支原體熒光定量檢測試劑盒及其檢測方法。
背景技術(shù):
雞毒支原體(Mycoplasma gallisepticum,MG)感染是雞慢性呼吸道病的一種,感染MG的雞臨床癥狀包括咳嗽、打噴嚏、鼻炎、結(jié)膜炎,呼吸時(shí)伴有鼻分泌物,也有可能患上單側(cè)或者雙側(cè)鼻竇炎。感染后會(huì)引起蛋雞產(chǎn)蛋率下降,肉雞體重減輕。雞毒支原體不同菌株的感染性和致病性不同,有時(shí)感染性并不明顯。傳播方式主要為垂直傳播和水平傳播,1943年,Delaplane等首次從感染雞群中分離出該病原體,此病流行范圍遍布世界,我國支原體感染陽性率已達(dá)50%~80%,成為威脅我國養(yǎng)禽業(yè)的重要疾病之一。
雞毒支原體感染,主要表現(xiàn)為慢性呼吸道癥狀,無其他特征性的臨床癥狀,同時(shí)易與其他細(xì)菌或病毒繼發(fā)和混合感染,給臨床診斷帶來困難。支原體培養(yǎng)營養(yǎng)要求高,體外培養(yǎng)生長緩慢,耗時(shí)較長,所以傳統(tǒng)的分離培養(yǎng)法不能滿足臨床診斷的需要,目前分子生物學(xué)方法在臨床診斷中因快速、靈敏的特點(diǎn),應(yīng)用越來越廣泛。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明針對現(xiàn)有技術(shù)中存在的不足,目的在于提供一種雞毒支原體熒光定量檢測試劑盒及其檢測方法。
為實(shí)現(xiàn)上述發(fā)明目的,本發(fā)明所采用的技術(shù)方案為:
一種雞毒支原體熒光定量檢測試劑盒,包括:熒光定量PCR反應(yīng)液、陽性對照和陰性對照,所述熒光定量PCR反應(yīng)液中包含上游引物和下游引物。
上述方案中,所述上游引物的序列為:5’-GAGCTAATCTGTAAAGTTGGTC-3’;所述下游引物的序列為:5’-GCTTCCTTGCGGTTAGCAAC-3’。
上述方案中,所述熒光定量PCR反應(yīng)液中還包含SYBR Premix Ex Taq(Tli RNaseH Plus)。
上述方案中,所述熒光定量PCR反應(yīng)液的組成為:10μmol/L上游引物0.25μL,10μmol/L下游引物0.25μL,SYBR Premix Ex Taq(Tli RNaseH Plus)5μL。
上述方案中,所述陰性對照為DEPC處理水。
上述方案中,所述陽性對照為:滅活的雞毒支原體活疫苗按1:1000倍稀釋的稀釋液。
利用上述試劑盒進(jìn)行雞毒支原體熒光定量PCR的檢測方法,包括如下步驟:
(1)將待測樣品溶于DEPC水,煮沸、冰浴、離心后取上清作為待測樣品檢測模板DNA;
(2)取步驟(1)所得樣品檢測模板DNA與熒光定量PCR反應(yīng)液配成反應(yīng)體系進(jìn)行熒光定量PCR反應(yīng);同時(shí)配制陽性對照反應(yīng)體系、陰性對照反應(yīng)體系同步進(jìn)行熒光定量PCR反應(yīng);
(3)讀取樣品檢測通道、陽性對照檢測通道和陰性對照檢測通道的熒光數(shù)據(jù),進(jìn)行結(jié)果判定:陰性對照檢測通道應(yīng)均無Ct值并且無擴(kuò)增曲線;陽性對照檢測通道應(yīng)均有特征性“S”型擴(kuò)增曲線,且Ct值小于32,Tm值為84.7℃±1.5℃,則表明實(shí)驗(yàn)成功,可進(jìn)行樣品的陰性/陽性結(jié)果判斷,否則實(shí)驗(yàn)視為無效;
樣品陰性結(jié)果判斷:樣品檢測通道無特征性擴(kuò)增曲線、或Ct值≥32但Tm值不在84.1℃±1.5℃范圍內(nèi),則表明樣品中不含雞毒支原體;
樣品陽性結(jié)果判斷:樣品檢測通道出現(xiàn)“S”型擴(kuò)增曲線,且Ct值小于32,且Tm值為84.1℃±1.5℃,則表明樣品中含有雞毒支原體。
上述方案中,所述熒光定量PCR反應(yīng)為:第一階段,預(yù)變性,95℃3min;第二階段,95℃15s,59℃40s,40個(gè)循環(huán),每次循環(huán)的59℃退火延伸時(shí)收集熒光信號;第三階段,生成融解曲線。
本發(fā)明所述雞毒支原體熒光定量PCR檢測方法中,若檢測樣品出現(xiàn)典型的擴(kuò)增曲線,Ct值大于或等于32,且Tm值在84.1℃±1.5℃范圍內(nèi),應(yīng)將樣品進(jìn)行10倍稀釋后復(fù)檢;若仍出現(xiàn)典型擴(kuò)增曲線,Ct值大于或等于32,且Tm值為84.1℃±1.5℃,則判為陽性,否則判為陰性。
本發(fā)明分別選擇雞毒支原體(MG)的16s rRNA基因的保守序列設(shè)計(jì)引物。引物長度為22個(gè)堿基左右,引物內(nèi)無二級結(jié)構(gòu)和重復(fù)性,引物間和引物內(nèi)無互補(bǔ)序列,引物間的融解溫度(Tm值)相差小于5℃。
本發(fā)明的有益效果:
(1)采用本發(fā)明所述試劑盒對樣品進(jìn)行雞毒支原體熒光定量PCR檢測,樣品的預(yù)處理過程非常簡單,即不需要對樣品進(jìn)行支原體培養(yǎng),也不需要對樣品中進(jìn)行支原體基因提取,只需將樣品直接煮沸后冷卻即可,本發(fā)明所述檢測方式簡化了常規(guī)熒光定量PCR檢測方法中樣品的預(yù)處理過程,具有省時(shí)、省操作、節(jié)約成本等優(yōu)點(diǎn);同時(shí)全封閉反應(yīng),無需PCR后處理,操作安全;并且通過PCR產(chǎn)物進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光監(jiān)控,PCR結(jié)束即可獲得結(jié)果,具有快速檢測的優(yōu)勢;
(2)本發(fā)明所述雞毒支原體熒光定量檢測試劑盒具有檢測靈敏度高、特異性好、重復(fù)穩(wěn)定性好等優(yōu)點(diǎn):試劑盒的靈敏度可達(dá)100拷貝/反應(yīng);使用試劑盒檢測大腸桿菌、沙門氏菌、巴氏桿菌、副雞嗜血桿菌、葡萄球菌等細(xì)菌,均顯示無交叉反應(yīng),使用試劑盒檢測雞毒支原體顯示出良好的特異性;使用試劑盒多次對含有不同濃度模板DNA的樣品進(jìn)行重復(fù)檢測,均能檢測出來,說明可重復(fù)度高;
(3)本發(fā)明所述試劑盒及其檢測方法非常適用于雞咽喉拭子中雞毒支原體(MG)的檢測,適用于隱性感染或帶毒雞群的快速篩查。
附圖說明
圖1為以滅活的雞毒支原體活疫苗(F36株)為樣品的檢測結(jié)果,曲線從左到右依次為樣本進(jìn)行10-2、10-3、10-4、10-5、10-6稀釋后的擴(kuò)增曲線。
圖2為以滅活的雞毒支原體活疫苗(F36株)為樣本的檢測結(jié)果,峰高從高到低的曲線依次為樣本進(jìn)行10-2、10-3、10-4、10-5、10-6稀釋、擴(kuò)增后融解曲線。
圖3為以大腸桿菌、沙門氏菌、巴氏桿菌、副雞嗜血桿菌、葡萄球菌為樣本,以滅活的雞毒支原體活疫苗為陽性對照的檢測結(jié)果,其中“S”型曲線為陽性對照的擴(kuò)增曲線,其他樣本的均為起線。
圖4為以大腸桿菌、沙門氏菌、巴氏桿菌、副雞嗜血桿菌、葡萄球菌為樣本,以滅活的雞毒支原體活疫苗為陽性對照的檢測結(jié)果,其中,有融解峰的曲線為陽性對照融解曲線,其他樣本均沒有出現(xiàn)融解峰。
具體實(shí)施方式
為了更好地理解本發(fā)明,下面結(jié)合實(shí)施例進(jìn)一步闡明本發(fā)明的內(nèi)容,但本發(fā)明的內(nèi)容不僅僅局限于下面的實(shí)施例。
實(shí)施例1
(1)引物的設(shè)計(jì)
根據(jù)Genbank登錄的已發(fā)表的雞毒支原體(MG)16S rRNA基因序列(Genbank登錄號KC995374.1)設(shè)計(jì)引物。通過分析實(shí)驗(yàn),得到以下引物:
雞毒支原體-上游引物:5’-GAGCTAATCTGTAAAGTTGGTC-3’
雞毒支原體-上游引物:5’-GCTTCCTTGCGGTTAGCAAC-3’。
(2)待檢樣品處理
a.取滅菌的1.5mL離心管,加入400μL無菌的PBS,將采集的咽喉拭子于PBS中旋轉(zhuǎn)洗滌,保留洗滌液;
b.將上述洗滌液12000r/min離心10min,棄上清,保留沉淀物;
c.將沉淀物加入400μL DEPC水混勻,于100℃水浴鍋中煮沸10min,煮沸后冰浴10min,2000r/min離心3min,上清作為樣品檢測模板DNA;
d.同時(shí)取陽性對照10μl加入400μLDEPC水混勻,重復(fù)步驟c的操作,上清作為陽性對照檢測模板DNA。
(3)PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系配制
5μL SYBR Premix Ex Taq(Tli RNaseH Plus)分別加入0.25μL、10μmol/L上游引物、0.25μL、10μmol/L下游引物,充分混合均勻后,即得到熒光PCR反應(yīng)液(見表1),再在熒光PCR反應(yīng)液中加入4.5μL樣品檢測模板DNA/陽性對照檢測模板DNA/陰性對照檢測模板DNA,最終配成10μL的PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系(1羽份)。
表1熒光PCR反應(yīng)液(1羽份,5.5μl)
其中,SYBR Premix Ex Taq(Tli RNaseH Plus)購于大連寶生物生物工程有限公司,引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。
實(shí)施例2雞毒支原體熒光定量PCR檢測
(1)將上述PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系進(jìn)行熒光定量PCR檢測,熒光定量PCR反應(yīng)的參數(shù)設(shè)計(jì)如下:第一階段:預(yù)變性,95℃3min;第二階段:95℃15s,59℃40s,40個(gè)循環(huán),在第二階段每次循環(huán)的59℃退火延伸時(shí)收集熒光;第三階段,生成融解曲線。
(2)分別讀取樣品檢測通道、陽性對照檢測通道和陰性對照檢測通道的熒光數(shù)據(jù),進(jìn)行結(jié)果判定:陰性對照檢測通道應(yīng)均無Ct值并且無擴(kuò)增曲線,陽性對照檢測通道應(yīng)均有特征性“S”型擴(kuò)增曲線,且Ct值小于32,Tm值為84.7℃±1.5℃,則表明實(shí)驗(yàn)成功,可進(jìn)行樣品的陰性/陽性結(jié)果判斷,否則實(shí)驗(yàn)視為無效;
樣品陰性結(jié)果判斷:樣品檢測通道無特征性擴(kuò)增曲線、或Ct值≥32但Tm值不在84.1℃±1.5℃范圍內(nèi),則表明樣品中不含雞毒支原體;
樣品陽性結(jié)果判斷:樣品檢測通道出現(xiàn)“S”型擴(kuò)增曲線,且Ct值小于32,且Tm值為84.1℃±1.5℃,則表面樣品中含有雞毒支原體。
同時(shí),若檢測樣品出現(xiàn)典型的擴(kuò)增曲線,Ct值大于或等于32,且Tm值在84.1℃±1.5℃范圍內(nèi),應(yīng)將樣品進(jìn)行10倍稀釋后復(fù)檢;若仍出現(xiàn)典型擴(kuò)增曲線,Ct值大于或等于32,且Tm值為84.1℃±1.5℃,則判為陽性,否則判為陰性。
實(shí)施例3可行性實(shí)驗(yàn)
以滅活的雞毒支原體活疫苗為樣品,采用實(shí)施例1、實(shí)施例2的方法進(jìn)行雞毒支原體熒光定量PCR檢測,檢測結(jié)果顯示:樣品出現(xiàn)典型的擴(kuò)增曲線,Ct值小于32,Tm值為84.1℃。說明本發(fā)明所述試劑盒及其檢測方法具有確定的可行性。
實(shí)施例4靈敏性實(shí)驗(yàn)
以滅活的雞毒支原體活疫苗為樣品,將其用DEPC水進(jìn)行10-2、10-3、10-4、10-5、10-6稀釋后,采用實(shí)施例1、實(shí)施例2的方法進(jìn)行雞毒支原體熒光定量PCR檢測,檢測結(jié)果如圖1、圖2所示,圖1從左到右的曲線分別代表稀釋了10-2、10-3、10-4、10-5、10-6的雞毒支原體活疫苗樣品,圖2中峰高從高到低的曲線分別代表稀釋了10-2、10-3、10-4、10-5、10-6的雞毒支原體活疫苗樣品,從圖1和圖2可以看出:雞毒支原體稀釋10-6倍數(shù)后仍然能被本發(fā)明所述試劑盒及其檢測方法檢出,說明本發(fā)明所述試劑盒具有非常好的特異性和非常高的靈敏性。通過對雞毒支原體活疫苗樣品進(jìn)行拷貝數(shù)測定后,再采用本發(fā)明所述試劑盒進(jìn)行檢測,結(jié)果顯示,本發(fā)明所述試劑盒的靈敏度能達(dá)到100拷貝/反應(yīng);同時(shí)使用本發(fā)明所述試劑盒多次對含有不同濃度模板DNA的樣品進(jìn)行重復(fù)檢測,均能檢測出來,說明可重復(fù)度高。
實(shí)施例5特異性實(shí)驗(yàn)
分別以大腸桿菌、沙門氏菌、巴氏桿菌、副雞嗜血桿菌、葡萄球菌為樣品,以雞毒支體為陽性對照,采用實(shí)施例1、2的方法進(jìn)行熒光定量PCR,結(jié)果如圖3、圖4所示,從圖3和圖4可以看出:大腸桿菌、沙門氏菌、巴氏桿菌、副雞嗜血桿菌、葡萄球菌樣品均無特征性擴(kuò)增曲線,無特異性融解峰,而陽性對照(雞毒支原體樣品)出現(xiàn)“S”型曲線擴(kuò)增曲線和特異性融解峰,表明本發(fā)明所述試劑盒具有非常好的特異性。
顯然,上述實(shí)施例僅僅是為清楚地說明所作的實(shí)例,而并非對實(shí)施方式的限制。對于所屬領(lǐng)域的普通技術(shù)人員來說,在上述說明的基礎(chǔ)上還可以做出其它不同形式的變化或變動(dòng)。這里無需也無法對所有的實(shí)施方式予以窮舉。而因此所引申的顯而易見的變化或變動(dòng)仍處于本發(fā)明創(chuàng)造的保護(hù)范圍之內(nèi)。