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一種催化木質(zhì)素芳香醚單體O-脫甲基化的突變體及其應(yīng)用的制作方法

文檔序號(hào):39706714發(fā)布日期:2024-10-22 12:51閱讀:1來源:國知局
一種催化木質(zhì)素芳香醚單體O-脫甲基化的突變體及其應(yīng)用的制作方法

本發(fā)明屬于生物催化,具體涉及一種催化木質(zhì)素芳香醚單體o-脫甲基化的突變體及其應(yīng)用。


背景技術(shù):

1、木質(zhì)素是在陸地植物中發(fā)現(xiàn)的含量豐富卻未被充分利用的無定型芳香族聚合物,其結(jié)構(gòu)單元是4-羥?基苯丙烷(單酚),根據(jù)芳環(huán)上甲氧基數(shù)目和取代位置的不同,可分為4-羥基苯基(h),愈創(chuàng)木酰基(g)和丁香基(s)。作為自然界中最豐富的可再生芳香族聚合物,地球上的植物每年約生產(chǎn)5-36?億噸木質(zhì)素,此外,作為最大的利用植物生物質(zhì)為原料的化學(xué)工藝行業(yè),紙漿和造紙業(yè)每年產(chǎn)生約6000萬噸木質(zhì)素“廢物”,如此龐大的木質(zhì)素輸出,其降解對(duì)自然界碳循環(huán)具有不可忽視的影響,但由于木質(zhì)素具有異質(zhì)性,大多數(shù)生物體難以對(duì)其進(jìn)行降解。因此尋找一種高效的木質(zhì)素降解機(jī)制對(duì)環(huán)境保護(hù)和經(jīng)濟(jì)發(fā)展具有重要意義。

2、目前關(guān)于木質(zhì)素降解的方法主要是物理化學(xué)法和生物法。其中物理化學(xué)降解過程存在高耗能和“二次污染”的弊端,無法滿足綠色經(jīng)濟(jì)的發(fā)展需求,相比之下,生物降解因其作用條件溫和、來源廣泛、無污染等優(yōu)勢(shì)脫穎而出,成為近年來木質(zhì)素降解的熱門領(lǐng)域。微生物降解法因作用條件溫和、來源廣泛、無污染等優(yōu)勢(shì)成為近年來木質(zhì)素降解再利用的熱門策略,該策略利用腐爛真菌和某些細(xì)菌分泌的強(qiáng)大氧化酶將木質(zhì)素聚合物分解為小片段,然后再通過至少四種分解代謝方法進(jìn)一步降解為碳和能源。木質(zhì)素主要由愈創(chuàng)木酰基(g)和丁香基(s)兩種結(jié)構(gòu)單元構(gòu)成,它們?cè)诒江h(huán)上分別具有一個(gè)和兩個(gè)甲氧基,因此,幾乎所有木質(zhì)素芳香醚單體都必須先進(jìn)行脫甲基化反應(yīng)生成相應(yīng)的二醇中間物,然后才能將其氧化裂解生成開環(huán)化合物,從而參與到碳循環(huán)過程。因此,脫甲基化是天然碳循環(huán)以及新興生物技術(shù)中利用木質(zhì)素的關(guān)鍵反應(yīng)。2018年,mallinson等人全面表征了一種二組份蛋白p450?脫甲基酶,該酶由?cyp255a?家族的細(xì)胞色素p450酶(gcoa)和三結(jié)構(gòu)域還原酶(gcob)組成,可有效催化多種木質(zhì)素衍物的脫甲基,但是gcoab在反應(yīng)過程中需要消耗昂貴的nad(p)h,若用h2o2作為氧來源不僅可以大大縮短催化循環(huán)路徑,也可降低成本投入。cong課題組創(chuàng)新性提出了雙功能小分子(dfsm)驅(qū)動(dòng)的h2o2依賴型p450bm3過加氧酶,該體系可利用h2o2代替o2作為氧原子供體,催化非天然底物的氧化反應(yīng)。在細(xì)胞色素p450酶龐大的家族中,僅有少數(shù)特定p450能夠選擇性的催化芳香醚發(fā)生脫甲基化反應(yīng),大多數(shù)p450表現(xiàn)出多種氧化功能。之前,對(duì)雙功能小分子(dfsm)促進(jìn)的人工p450bm3過加氧酶系統(tǒng)的活性空間實(shí)現(xiàn)改造,構(gòu)建得p450bm3/dfsm系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)了木質(zhì)素g-木質(zhì)素脫甲基活性的提高。但仍存在對(duì)s-木質(zhì)素(2,6-二甲氧基苯酚)單脫甲基化催化的缺點(diǎn)。


技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路

1、針對(duì)現(xiàn)有技術(shù)的不足,本發(fā)明提供了一種催化木質(zhì)素芳香醚單體o-脫甲基化的p450突變酶。本發(fā)明采用p450bm3-aldo體系研究p450突變酶催化木質(zhì)素芳香醚單體o-脫甲基化。

2、本發(fā)明的技術(shù)方案如下:

3、一種催化木質(zhì)素芳香醚單體o-脫甲基化的突變體,突變體為細(xì)胞色素p450bm3氧化酶第87位苯丙氨酸處的位點(diǎn)突變;所述第87位苯丙氨酸處位點(diǎn)突變?yōu)楸彼峄蚋拾彼?;?xì)胞色素p450bm3氧化酶的氨基酸序列如seq?id?no.1所示,核苷酸序列如seq?id?no.2所示。

4、所述突變體還可疊加于細(xì)胞色素p450bm3氧化酶的下述氨基酸位點(diǎn)中的一個(gè)或幾個(gè)進(jìn)行突變:下述第78位纈氨酸處、第328位丙氨酸和第268位蘇氨酸處。

5、進(jìn)一步的說,利用雙功能小分子化合物im-c6-phe誘導(dǎo)所述p450酶的氧化結(jié)構(gòu)域突變體實(shí)現(xiàn)利用甘油氧化生成的h2o2高效催化木質(zhì)素芳香醚單體o-脫甲基化;其中,突變體為含所述第78位、第87位、第268位和第328位進(jìn)行突變的單、二、三或四突變體,所述第87位苯丙氨酸突變?yōu)楦拾彼峄虮彼?,?8位纈氨酸突變?yōu)楦拾彼峄虮彼幔?68位蘇氨酸變?yōu)楦彼峄蛱於彼?,?28位丙氨酸突變?yōu)楸奖彼幔痪唧w的突變體為:將seq?id?no.1所示氨基酸序列的第87位的苯丙氨酸替換為丙氨酸或甘氨酸;所得突變體依次命名為f87a(seq?id?no.3)、f87g(seq?id?no.4)。

6、將seq?id?no.1所示氨基酸序列的第87位的苯丙氨酸替換為丙氨酸,第78位的纈氨酸替換為甘氨酸或丙氨酸,第268位的蘇氨酸替換為天冬酸;所的突變體依次命名為f87a/v78a(seq?id?no.5)、f87a/v78g(seq?id?no.6)、f87a/t268d(seq?id?no.7)。

7、將seq?id?no.1所示氨基酸序列的第87位的苯丙氨酸替換為丙氨酸,第78位的纈氨酸替換為甘氨酸或丙氨酸,氨基酸序列的第268位的丙氨酸替換為脯氨酸或天冬氨酸,第328位丙氨酸替換為苯丙氨酸;所的突變體依次命名為f87a/v78a/t268p(seq?id?no.8)、f87a/v78g/t268p(seq?id?no.9)、f87a/t268d/a328f(seq?id?no.10)。

8、將seq?id?no.1所示氨基酸序列的第87位的苯丙氨酸替換為丙氨酸,第78位的纈氨酸突變?yōu)楸彼?,氨基酸序列的?68位的丙氨酸突變?yōu)樘於彼?,?28位的丙氨酸突變?yōu)楸奖彼岚彼?;所的突變體命名為f87a/v78a/t268d/a328f(seq?id?no.11)。

9、一種表達(dá)載體,表達(dá)載體含所述任意一項(xiàng)突變體的基因。

10、一種基因工程菌,基因工程菌含有所述的表達(dá)載體。

11、一種突變體的應(yīng)用,所述突變體在催化木質(zhì)素芳香醚單體o-脫甲基化。

12、所述催化體系為雙功能小分子化合物、所述突變體、甘油、糖醇氧化酶(aldo)和底物;其中,雙功能小分子化合物為n-(ω-咪唑基,脂肪?;?-l-苯丙氨酸衍生物。

13、作為具體的實(shí)施方式,利用所述突變體協(xié)同選擇性催化以愈創(chuàng)木酚、2,6-二甲氧基苯酚為底物o-脫甲基的方法,利用具有雙功能的小分子n-(ω-咪唑基,脂肪?;?-l-苯丙氨酸衍生物誘導(dǎo)所述p450酶的氧化結(jié)構(gòu)域突變體,實(shí)現(xiàn)通過aldo氧化甘油持續(xù)性h2o2分別催化愈創(chuàng)木酚和2,6-二甲氧基苯酚脫甲基生成鄰苯二酚和焦棓酸、3-甲氧基鄰苯二酚。

14、進(jìn)一步地說,利用雙功能小分子化合物im-c6-phe誘導(dǎo)所述p450酶的氧化結(jié)構(gòu)域突變體實(shí)現(xiàn)通過糖醇氧化酶(alcohol?oxidase,簡寫aldo)氧化甘油持續(xù)性利用h2o2分別催化愈創(chuàng)木酚和2,6-二甲氧基苯酚脫甲基生成鄰苯二酚和焦棓酸、3-甲氧基鄰苯二酚;其中,突變體為含所述第87位、第78位、第328位和第268位進(jìn)行突變的單、二、三或四的突變體,所述第87位苯丙氨酸突變?yōu)楦拾彼峄虮彼?,?8位纈氨酸突變?yōu)楦拾彼峄虮彼?,?68位蘇氨酸變?yōu)楦彼峄蛱於彼幔?28位丙氨酸突變?yōu)楸奖彼?;所述催化反?yīng)體系為向反應(yīng)體系為1?ml的磷酸鈉緩沖液(100?mm、ph?8.0)中依次加入4?mm底物、0.5?μm?p450bm3系列突變體、0.5?mm?雙功能小分子,1%v/v甘油,25?℃孵育5?min后加入2.5?μm?aldo,反應(yīng)90min。

15、上述底物為愈創(chuàng)木酚和2,6-二甲氧基苯酚。

16、本發(fā)明通過蛋白質(zhì)工程技術(shù)與雙功能小分子協(xié)同策略的雙重調(diào)控能力相結(jié)合,實(shí)現(xiàn)了對(duì)愈創(chuàng)木酚和2,6-二甲氧基苯的綠色高效轉(zhuǎn)化,實(shí)現(xiàn)了p450bm3催化體系的優(yōu)化和底物范圍的拓展,為生物催化領(lǐng)域的進(jìn)一步研究提供了新的思路和方法。

17、具體是:以來源于巨大芽孢桿菌的細(xì)胞色素p450-bm3單加氧酶氧化酶部分為模板,利用含有87突變位點(diǎn)的突變引物進(jìn)行pcr突變,測(cè)序獲得f87單突變體;然后以單突變體基因?yàn)槟0澹酝瑯拥姆椒╬cr擴(kuò)增出f87-v78組合和f87-t268組合雙突變體;然后以雙突變體基因?yàn)槟0?,以同樣的方法pcr擴(kuò)增出f87-v78-t268組合和f87-t268-a328三突變體,然后以三突變體基因?yàn)槟0?,以同樣的方法pcr擴(kuò)增出f87-v78a-t268-a328,以此p450bm3-aldo系統(tǒng)催化木質(zhì)素芳香醚單體o-脫甲基化效果大幅提升。實(shí)驗(yàn)證實(shí),與p450bm3-h2o2系統(tǒng)相比,催化效率高達(dá)原系統(tǒng)的5倍。

18、與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明具有以下有益效果:

19、本發(fā)明通過對(duì)p450bm3定向進(jìn)化,利用隨機(jī)突變高通量篩選獲取催化催化木質(zhì)素芳香醚單體o-脫甲基化的優(yōu)勢(shì)突變體,通過對(duì)優(yōu)勢(shì)突變位點(diǎn)的半理性設(shè)計(jì),構(gòu)建“小而精”的突變體文庫,提高了篩選效率,在p450bm3-aldo體系下,f87a/v78a/t268d/a328f突變體對(duì)愈創(chuàng)木酚的選擇性高達(dá)99.9%(ton=1895),具有最高的周轉(zhuǎn)次數(shù)。同時(shí),f87a/t268d突變體對(duì)2,6-二甲氧基苯酚的轉(zhuǎn)化率最高(ton=483),并成功地實(shí)現(xiàn)了雙脫甲基??傊?,我們認(rèn)為可以通過蛋白質(zhì)工程進(jìn)一步提高催化活性,為木質(zhì)素的分解利用提供了一種更加高效且經(jīng)濟(jì)的方法。

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