背景技術(shù):
1、重組腺相關(guān)病毒(raav)提供用于體內(nèi)遞送基因療法的主要平臺。目前的臨床試驗采用有限數(shù)量的aav衣殼,主要來自天然存在的人或靈長類血清型,諸如aav1、aav2、aav5、aav6、aav8、aav9、aavrh.10、aav4rh.74和aavhu.67。由于所關(guān)注組織的低感染性和競爭性肝向性,這些衣殼通常提供對所關(guān)注組織的次優(yōu)靶向。增加劑量以確保所需組織的感染可導(dǎo)致劑量依賴性肝毒性。此外,使用天然存在的衣殼會帶來免疫記憶方面的挑戰(zhàn),即免疫前患者群體被排除在治療之外,并且在先前未免疫患者中重復(fù)給藥通常是不可能的。因此,需要用于基因療法的另外的aav衣殼,特別是賦予raav對特定組織(諸如肌肉組織和中樞神經(jīng)系統(tǒng)中的組織)的高感染性和低肝向性的衣殼。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、本文描述了用于高通量工程化對各種組織具有改變的向性的功能性aav衣殼和對靶組織(諸如肌肉或中樞神經(jīng)系統(tǒng)(cns)組織)具有增加的向性的衣殼變體的系統(tǒng)。
2、在各個方面,本公開提供了一種病毒蛋白(vp)衣殼多肽,其中所述vp衣殼多肽包含對應(yīng)于vp1多肽的殘基581至589的581-589區(qū)域,其中所述581-589區(qū)域與seq?id?no:9相比包含至少一個氨基酸取代,并且其中包含所述vp衣殼多肽的重組病毒衣殼能夠以是野生型aav9的至少100倍的dna富集優(yōu)先靶向中樞神經(jīng)系統(tǒng)(cns)組織。
3、在一些方面,所述581-589區(qū)域具有選自由以下組成的組的序列:seq?id?no:18、seq?id?no:3472、seq?id?no:262、seq?id?no:3306、seq?id?no:2028、seq?id?no:2791、seqid?no:424、seq?id?no:2536、seq?id?no:1971、seq?id?no:415、seq?id?no:3846、seq?idno:3283、seq?id?no:1956、seq?id?no:3297、seq?id?no:4545、seq?id?no:2661、seq?idno:1576、seq?id?no:425、seq?id?no:709、seq?id?no:2168、seq?id?no:54、seq?id?no:429、seq?id?no:708、seq?id?no:428、seq?id?no:4119、seq?id?no:3906、seq?id?no:2456、seq?id?no:2278、seq?id?no:5006、seq?id?no:426、seq?id?no:307、seq?id?no:5155、seqid?no:2640、seq?id?no:4317、seq?id?no:1145、seq?id?no:430和seq?id?no:885。在一些方面,所述重組病毒衣殼能夠以是所述野生型aav9的至少200倍的dna富集優(yōu)先靶向所述cns組織。在一些方面,所述581-589區(qū)域具有選自由以下組成的組的序列:seq?id?no:18、seq?id?no:3472、seq?id?no:262、seq?id?no:3306、seq?id?no:2028、seq?id?no:2791、seqid?no:424、seq?id?no:2536、seq?id?no:1971、seq?id?no:415、seq?id?no:3846、seq?idno:3283、seq?id?no:1956和seq?id?no:3297。在一些方面,所述重組病毒衣殼能夠以是所述野生型aav9的至少1000倍的dna富集優(yōu)先靶向所述cns組織。在一些方面,所述581-589區(qū)域具有seq?id?no:18的序列。
4、在各個方面,本公開提供了一種病毒蛋白(vp)衣殼多肽,其中所述vp衣殼多肽包含對應(yīng)于vp1多肽的殘基581至589的581-589區(qū)域,其中所述581-589區(qū)域與seq?id?no:9相比包含至少一個氨基酸取代,并且其中包含所述vp衣殼多肽的重組病毒衣殼能夠以是野生型aav9的至少100倍的rna富集優(yōu)先靶向中樞神經(jīng)系統(tǒng)(cns)組織。
5、在一些方面,所述581-589區(qū)域具有選自由以下組成的組的序列:seq?id?no:18、seq?id?no:3472、seq?id?no:262、seq?id?no:3306、seq?id?no:2028、seq?id?no:2791、seqid?no:424、seq?id?no:2536、seq?id?no:1971、seq?id?no:415、seq?id?no:3283、seq?idno:1956、seq?id?no:3297、seq?id?no:4545、seq?id?no:2661、seq?id?no:1576、seq?idno:425、seq?id?no:709、seq?id?no:54、seq?id?no:429、seq?id?no:428、seq?id?no:426和seq?id?no:430。在一些方面,所述重組病毒衣殼能夠以是所述野生型aav9的至少200倍或更高的rna富集優(yōu)先靶向所述cns組織。在一些方面,所述581-589區(qū)域具有選自由以下組成的組的序列:seq?id?no:18、seq?id?no:3472、seq?id?no:262、seq?id?no:3306、seq?idno:2028、seq?id?no:2791、seq?id?no:424、seq?id?no:2536、seq?id?no:1971、seq?id?no:415、seq?id?no:3283、seq?id?no:1956、seq?id?no:2661、seq?id?no:1576、seq?id?no:425、seq?id?no:709、seq?id?no:54、seq?id?no:430、seq?id?no:569和seq?id?no:719。在一些方面,所述重組病毒衣殼能夠以是所述野生型aav9的至少500倍或更高的rna富集優(yōu)先靶向所述cns組織。在一些方面,所述581-589區(qū)域具有選自由以下組成的組的序列:seq?idno:18、seq?id?no:3472、seq?id?no:262和seq?id?no:2028。
6、在各個方面,本公開提供了一種病毒蛋白(vp)衣殼多肽,其中所述vp衣殼多肽包含對應(yīng)于vp1多肽的殘基581至589的581-589區(qū)域,其中所述581-589區(qū)域與seq?id?no:9相比包含至少一個氨基酸取代,并且其中包含所述vp衣殼多肽的重組病毒衣殼能夠以是野生型aav5的至少5倍的dna富集優(yōu)先靶向中樞神經(jīng)系統(tǒng)(cns)組織。
7、在一些方面,所述581-589區(qū)域具有選自由以下組成的組的序列:seq?id?no:18、seq?id?no:3472、seq?id?no:262、seq?id?no:3306、seq?id?no:2028、seq?id?no:2791、seqid?no:424、seq?id?no:2536、seq?id?no:1971、seq?id?no:415、seq?id?no:3846、seq?idno:3283、seq?id?no:1956、seq?id?no:3297、seq?id?no:4545、seq?id?no:2661和seq?idno:1576。在一些方面,所述重組病毒衣殼能夠以是所述野生型aav5的至少10倍的dna富集優(yōu)先靶向所述cns組織。在一些方面,所述581-589區(qū)域具有選自由以下組成的組的序列:seq?id?no:18、seq?id?no:3472、seq?id?no:262、seq?id?no:3306、seq?id?no:2028、seqid?no:2791和seq?id?no:424。
8、在各個方面,本公開提供了一種病毒蛋白(vp)衣殼多肽,其中所述vp衣殼多肽包含對應(yīng)于vp1多肽的殘基581至589的581-589區(qū)域,其中所述581-589區(qū)域與seq?id?no:9相比包含至少一個氨基酸取代,并且其中包含所述vp衣殼多肽的重組病毒衣殼能夠以是野生型aav5的至少5倍的rna富集優(yōu)先靶向中樞神經(jīng)系統(tǒng)(cns)組織。
9、在一些方面,所述581-589區(qū)域具有選自由以下組成的組的序列:seq?id?no:18、seq?id?no:3472、seq?id?no:262、seq?id?no:3306、seq?id?no:2028、seq?id?no:2791、seqid?no:424、seq?id?no:2536、seq?id?no:1971、seq?id?no:415、seq?id?no:3283、seq?idno:1956、seq?id?no:3297、seq?id?no:4545、seq?id?no:2661、seq?id?no:1576、seq?idno:425、seq?id?no:709、seq?id?no:54、seq?id?no:429、seq?id?no:708、seq?id?no:428、seq?id?no:426、seq?id?no:307、seq?id?no:4317、seq?id?no:430和seq?id?no:885。在一些方面,所述重組病毒衣殼能夠以是所述野生型aav5的至少20倍的rna富集優(yōu)先靶向所述cns組織。在一些方面,所述581-589區(qū)域具有選自由以下組成的組的序列:seq?id?no:18、seq?id?no:3472、seq?id?no:262、seq?id?no:3306、seq?id?no:2028、seq?id?no:2791、seqid?no:424、seq?id?no:2536、seq?id?no:1971、seq?id?no:415、seq?id?no:3283、seq?idno:1956、seq?id?no:2661、seq?id?no:1576、seq?id?no:425、seq?id?no:709、seq?id?no:54、seq?id?no:430、seq?id?no:569和seq?id?no:719。
10、在各個方面,本公開提供了一種病毒蛋白(vp)衣殼多肽,其中所述vp衣殼多肽包含對應(yīng)于vp1多肽的殘基581至589的581-589區(qū)域;其中所述581-589區(qū)域具有與以下序列具有至少85%同一性的序列:(a)seq?id?no:18,(b)seq?id?no:3472,(c)seq?id?no:262,(d)seq?id?no:3306,(e)seq?id?no:2028,(f)seq?id?no:2791,(g)seq?id?no:424,(h)seqid?no:2536,(i)seq?id?no:1971,(j)seq?id?no:415,(k)seq?id?no:3846,(l)seq?id?no:3283,(m)seq?id?no:1956,(n)seq?id?no:3297,(o)seq?id?no:4545,(p)seq?id?no:2661,(q)seq?id?no:1576,(r)seq?id?no:425,(s)seq?idno:709,(t)seq?id?no:2168,(u)seqid?no:54,(v)seq?id?no:429,(w)seq?id?no:708,(x)seq?id?no:428,(y)seq?id?no:4119,(z)seq?id?no:3906,(aa)seq?id?no:2456,(bb)seq?id?no:2278,(cc)seq?id?no:5006,或(dd)seq?id?no:426。
11、在一些方面,所述581-589區(qū)域具有以下的序列:(a)seq?id?no:18,(b)seq?idno:3472,(c)seq?id?no:262,(d)seq?id?no:3306,(e)seq?id?no:2028,(f)seq?id?no:2791,(g)seq?id?no:424,(h)seq?id?no:2536,(i)seq?id?no:1971,(j)seq?id?no:415,(k)seq?id?no:3846,(l)seq?id?no:3283,(m)seq?id?no:1956,(n)seq?id?no:3297,(o)seq?id?no:4545,(p)seq?id?no:2661,(q)seq?id?no:1576,(r)seq?id?no:425,(s)seq?idno:709,(t)seq?id?no:2168,(u)seq?id?no:54,(v)seq?id?no:429,(w)seq?id?no:708,(x)seq?id?no:428,(y)seq?id?no:4119,(z)seq?id?no:3906,(aa)seq?id?no:2456,(bb)seq?id?no:2278,(cc)seq?id?no:5006,或(dd)seq?id?no:426。
12、在各個方面,本公開提供了一種病毒蛋白(vp)衣殼多肽,581-589其中所述vp衣殼多肽包含對應(yīng)于vp1多肽的殘基581至589的581-589區(qū)域;其中所述581-589區(qū)域具有與seqid?no:12-seq?id?no:3937或seq?id?no:3938-seq?id?no:4237中的任一者具有至少85%同一性的序列。
13、在一些方面,所述581-589區(qū)域具有seq?id?no:12-seq?id?no:3937或seq?id?no:3938-seq?id?no:4237中的任一者的序列。在一些方面,所述vp衣殼多肽能夠組裝成重組病毒衣殼。
14、在各個方面,本公開提供了一種病毒蛋白(vp)衣殼多肽,其中所述vp衣殼多肽能夠組裝成重組病毒衣殼,并且其中所述vp衣殼多肽包含對應(yīng)于vp1多肽的殘基581至589的581-589區(qū)域;其中所述581-589區(qū)域:與seq?id?no:9相比包含至少一個氨基酸取代,并且以是seq?id?no:1的野生型vp衣殼多肽的至少3倍的中樞神經(jīng)系統(tǒng)(cns)向性賦予所述重組病毒衣殼對cns組織的感染率;其中所述vp衣殼多肽與seq?id?no:3、seq?id?no:4、seq?idno:5、seq?id?no:6、seq?id?no:7和seq?id?no:8中的每一者相比包含至少一個氨基酸取代。
15、在一些方面,所述581-589區(qū)域包含序列x1x2x3x4x5x6x7x8x9,其中x1、x2、x3、x4、x5、x6、x7、x8和x9各自獨(dú)立地選自a、r、n、d、c、e、q、g、h、i、l、k、m、f、p、s、t、w、y和v。在一些方面,所述vp衣殼多肽具有seq?id?no:2的序列,其中seq?id?no:2的殘基581至589(x1x2x3x4x5x6x7x8x9)對應(yīng)于所述581-589區(qū)域。在一些方面,所述581-589區(qū)域具有與seq?idno:12-seq?id?no:3937中的任一者具有至少70%、至少77%、至少80%、至少88%、至少90%或至少95%同一性的序列。在一些方面,所述581-589區(qū)域具有seq?id?no:12-seq?idno:3937中的任一者的序列。在一些方面,所述581-589區(qū)域具有與seq?id?no:3938-seq?idno:4237中的任一者具有至少70%、至少77%、至少80%、至少88%、至少90%或至少95%同一性的序列。在一些方面,所述581-589區(qū)域具有seq?id?no:3938-seq?id?no:4237中的任一者的序列。
16、在一些方面,所述vp衣殼多肽包含與seq?id?no:1具有至少70%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少97%、至少98%、至少98.5%、至少99%或至少99.5%同一性的氨基酸序列。在一些方面,對cns組織的感染率是野生型vp衣殼多肽對cns組織的感染率的至少2.5倍、至少3倍、至少3.5倍、至少4倍、至少5倍、至少10倍、至少20倍、至少50倍、至少75倍、至少100倍、至少200倍、至少500倍或至少1000倍。在一些方面,與包含seq?id?no:1的肽的野生型aav5衣殼相比,所述581-589區(qū)域賦予由vp衣殼多肽組裝的重組病毒衣殼改善的穩(wěn)定性。在一些方面,與seq?id?no:1的野生型vp衣殼多肽相比,所述581-589區(qū)域在施用于受試者時賦予更低的毒性。在一些方面,所述cns組織選自前腦皮層、枕葉皮層、顳葉皮層、丘腦、下丘腦、黑質(zhì)、海馬體dg、海馬體ca1、海馬體ca3、小腦以及它們的任何組合。
17、在各個方面,本公開提供了一種藥物組合物,其包含如本文所述的vp衣殼多肽。
18、在一些方面,所述vp衣殼多肽組裝成重組病毒衣殼。在一些方面,所述藥物組合物還包含被重組病毒衣殼包封的有效負(fù)載。在一些方面,所述有效負(fù)載編碼治療性多核苷酸或治療性肽。在一些方面,所述有效負(fù)載編碼指導(dǎo)rna、trna、阻抑trna、sirna、mirna、mrna、shrna、環(huán)狀rna或反義寡核苷酸(aso)、核酶、dna酶、適體或它們的任何組合。在一些方面,所述有效負(fù)載編碼crispr/cas系統(tǒng)的組分、作用于rna(adar)酶的腺苷脫氨酶、轉(zhuǎn)錄活化子或轉(zhuǎn)錄抑制子。
19、在各個方面,本公開提供了一種重組腺相關(guān)病毒(raav),其包含組裝成重組病毒衣殼的如本文所述的vp衣殼多肽和被所述重組病毒衣殼包封的有效負(fù)載。
20、在一些方面,所述raav還包含含有581-589區(qū)域的vp2多肽和含有581-589區(qū)域的vp3多肽。在一些方面,所述有效負(fù)載編碼治療性多核苷酸或治療性肽。在一些方面,所述有效負(fù)載編碼指導(dǎo)rna、trna、阻抑trna、sirna、mirna、mrna、shrna、環(huán)狀rna或反義寡核苷酸(aso)、核酶、dna酶、適體或它們的任何組合。在一些方面,所述有效負(fù)載編碼crispr/cas系統(tǒng)的組分、作用于rna(adar)酶的腺苷脫氨酶、轉(zhuǎn)錄活化子或轉(zhuǎn)錄抑制子。
21、在各個方面,本公開提供了一種將有效負(fù)載遞送至受試者的中樞神經(jīng)系統(tǒng)(cns)組織的方法,所述方法包括:向所述受試者施用重組腺相關(guān)病毒(raav),其中所述raav包封所述有效負(fù)載,并且其中所述raav包含vp衣殼多肽,所述vp衣殼多肽包含對應(yīng)于vp1多肽的殘基581至589的581-589區(qū)域,其中所述581-589區(qū)域與seq?idno:9相比包含至少一個氨基酸取代;用所述raav感染所述cns組織;以及優(yōu)先將所述有效負(fù)載以是野生型aav9的至少100倍的dna富集遞送至被所述raav感染的所述cns組織。
22、在一些方面,所述dna富集是所述野生型aav9的至少200倍。在一些方面,所述dna富集是所述野生型aav9的至少1000倍。
23、在各個方面,本公開提供了一種在受試者的中樞神經(jīng)系統(tǒng)(cns)組織中轉(zhuǎn)錄有效負(fù)載的方法,所述方法包括:向所述受試者施用重組腺相關(guān)病毒(raav),其中所述raav包封所述有效負(fù)載,并且其中所述raav包含vp衣殼多肽,所述vp衣殼多肽包含對應(yīng)于vp1多肽的殘基581至589的581-589區(qū)域,其中所述581-589區(qū)域與seq?id?no:9相比包含至少一個氨基酸取代;用所述raav感染所述cns組織;以及優(yōu)先將所述有效負(fù)載以是野生型aav9的至少100倍的rna富集轉(zhuǎn)錄至被所述raav感染的所述cns組織。
24、在一些方面,所述dna富集是所述野生型aav9的至少200倍。在一些方面,所述dna富集是所述野生型aav9的至少500倍。
25、在各個方面,本公開提供了一種將有效負(fù)載遞送至受試者的中樞神經(jīng)系統(tǒng)(cns)組織的方法,所述方法包括:向所述受試者施用重組腺相關(guān)病毒(raav),其中所述raav包封所述有效負(fù)載,并且其中所述raav包含vp衣殼多肽,所述vp衣殼多肽包含對應(yīng)于vp1多肽的殘基581至589的581-589區(qū)域,其中所述581-589區(qū)域與seq?id?no:9相比包含至少一個氨基酸取代;用所述raav感染所述cns組織;以及優(yōu)先將所述有效負(fù)載以是野生型aav5的至少5倍的dna富集遞送至被所述raav感染的所述cns組織。
26、在一些方面,所述dna富集是所述野生型aav5的至少10倍。
27、在各個方面,本公開提供了一種在受試者的中樞神經(jīng)系統(tǒng)(cns)組織中轉(zhuǎn)錄有效負(fù)載的方法,所述方法包括:向所述受試者施用重組腺相關(guān)病毒(raav),其中所述raav包封所述有效負(fù)載,并且其中所述raav包含vp衣殼多肽,所述vp衣殼多肽包含對應(yīng)于vp1多肽的殘基581至589的581-589區(qū)域,其中所述581-589區(qū)域與seq?id?no:9相比包含至少一個氨基酸取代;用所述raav感染所述cns組織;以及優(yōu)先將所述有效負(fù)載以是野生型aav5的至少5倍的rna富集轉(zhuǎn)錄至被所述raav感染的所述cns組織。
28、在一些方面,所述dna富集是所述野生型aav5的至少20倍。
29、在各個方面,本公開提供了一種將有效負(fù)載遞送至受試者的中樞神經(jīng)系統(tǒng)(cns)組織的方法,所述方法包括:向所述受試者施用重組腺相關(guān)病毒(raav),其中所述raav包封所述有效負(fù)載,并且其中所述raav包含vp衣殼多肽,所述vp衣殼多肽包含對應(yīng)于vp1多肽的殘基581至589的581-589區(qū)域,其中所述581-589區(qū)域具有與以下序列具有至少85%同一性的序列:(a)seq?id?no:18,(b)seq?id?no:3472,(c)seq?id?no:262,(d)seq?id?no:3306,(e)seq?id?no:2028,(f)seq?id?no:2791,(g)seq?id?no:424,(h)seq?id?no:2536,(i)seqid?no:1971,(j)seq?id?no:415,(k)seq?id?no:3846,(l)seq?id?no:3283,(m)seq?id?no:1956,(n)seq?id?no:3297,(o)seq?id?no:4545,(p)seq?id?no:2661,(q)seq?id?no:1576,(r)seq?id?no:425,(s)seq?id?no:709,(t)seq?id?no:2168,(u)seq?id?no:54,(v)seq?idno:429,(w)seq?id?no:708,(x)seq?id?no:428,(y)seq?id?no:4119,(z)seq?id?no:3906,(aa)seq?id?no:2456,(bb)seq?id?no:2278,(cc)seq?id?no:5006,或(dd)seq?id?no:426;用與包含seq?id?no:1的肽的野生型aav5衣殼相比具有至少3倍的cns組織向性的所述raav感染所述cns組織;以及將所述有效負(fù)載遞送至被所述raav感染的所述cns組織。
30、在各個方面,本公開提供了一種將有效負(fù)載遞送至受試者的中樞神經(jīng)系統(tǒng)(cns)組織的方法,所述方法包括:向所述受試者施用重組腺相關(guān)病毒(raav),其中所述raav包封所述有效負(fù)載,并且其中所述raav包含vp衣殼多肽,所述vp衣殼多肽包含對應(yīng)于vp1多肽的殘基581至589的581-589區(qū)域,其中所述581-589區(qū)域與seq?id?no:1的殘基581至589相比包含至少一個氨基酸取代,并且其中所述vp衣殼多肽與seq?id?no:3、seq?id?no:4、seq?idno:5、seq?id?no:6、seq?id?no:7和seq?id?no:8中的每一者相比包含至少一個氨基酸取代;用與包含seq?id?no:1的肽的野生型aav5衣殼相比具有至少3倍的cns組織向性的所述raav感染所述cns組織;以及將所述有效負(fù)載遞送至被所述raav感染的所述cns組織。
31、在各個方面,本公開提供了一種將有效負(fù)載遞送至受試者的中樞神經(jīng)系統(tǒng)(cns)組織的方法,所述方法包括:向所述受試者施用重組腺相關(guān)病毒(raav),其中所述raav包封所述有效負(fù)載,并且其中所述raav包含如本文所述的vp衣殼多肽;用所述raav感染所述cns組織;以及將所述有效負(fù)載遞送至被所述raav感染的所述cns組織。
32、在一些方面,所述方法還包括在被所述raav感染的所述cns組織中表達(dá)由所述有效負(fù)載編碼的治療性多肽或治療性多核苷酸。在一些方面,所述方法還包括在所述受試者的所述cns組織中產(chǎn)生治療效果。在一些方面,所述治療效果在每kg受試者體重施用1×105至5×1014個raav時產(chǎn)生。在一些方面,所述方法包括施用足以在所述受試者中產(chǎn)生治療效果而不產(chǎn)生毒性的量的所述raav。在一些方面,所述cns組織包括前腦皮層、枕葉皮層、顳葉皮層、丘腦、下丘腦、黑質(zhì)、海馬體dg、海馬體ca1、海馬體ca3、小腦或它們的組合。
33、在各個方面,本公開提供了一種治療受試者的疾患的方法,所述方法包括:向所述受試者施用重組腺相關(guān)病毒(raav),其中所述raav包封有效負(fù)載,并且其中所述raav包含vp衣殼多肽,所述vp衣殼多肽包含對應(yīng)于vp1多肽的殘基581至589的581-589區(qū)域,其中所述581-589區(qū)域與seq?id?no:9相比包含至少一個氨基酸取代;用所述raav感染所述受試者的中樞神經(jīng)系統(tǒng)(cns)組織;優(yōu)先將所述有效負(fù)載以是野生型aav9的至少100倍的dna富集遞送至被所述raav感染的所述cns組織;以及在所述cns組織中產(chǎn)生治療效果,從而治療所述疾患。
34、在一些方面,所述dna富集是所述野生型aav9的至少200倍。在一些方面,所述dna富集是所述野生型aav9的至少1000倍。
35、在各個方面,本公開提供了一種治療受試者的疾患的方法,所述方法包括:向所述受試者施用重組腺相關(guān)病毒(raav),其中所述raav包封有效負(fù)載,并且其中所述raav包含vp衣殼多肽,所述vp衣殼多肽包含對應(yīng)于vp1多肽的殘基581至589的581-589區(qū)域,其中所述581-589區(qū)域與seq?id?no:9相比包含至少一個氨基酸取代;用所述raav感染所述受試者的中樞神經(jīng)系統(tǒng)(cns)組織;優(yōu)先將所述有效負(fù)載以是野生型aav9的至少100倍的rna富集轉(zhuǎn)錄至被所述raav感染的所述cns組織;以及在所述cns組織中產(chǎn)生治療效果,從而治療所述疾患。
36、在一些方面,所述dna富集是所述野生型aav9的至少200倍。在一些方面,所述dna富集是所述野生型aav9的至少500倍。
37、在各個方面,本公開提供了一種治療受試者的疾患的方法,所述方法包括:向所述受試者施用重組腺相關(guān)病毒(raav),其中所述raav包封有效負(fù)載,并且其中所述raav包含vp衣殼多肽,所述vp衣殼多肽包含對應(yīng)于vp1多肽的殘基581至589的581-589區(qū)域,其中所述581-589區(qū)域與seq?id?no:9相比包含至少一個氨基酸取代;用所述raav感染所述受試者的中樞神經(jīng)系統(tǒng)(cns)組織;優(yōu)先將所述有效負(fù)載以是野生型aav5的至少5倍的dna富集遞送至被所述raav感染的所述cns組織;以及在所述cns組織中產(chǎn)生治療效果,從而治療所述疾患。
38、在一些方面,所述dna富集是所述野生型aav5的至少10倍。
39、在各個方面,本公開提供了一種治療受試者的疾患的方法,所述方法包括:向所述受試者施用重組腺相關(guān)病毒(raav),其中所述raav包封有效負(fù)載,并且其中所述raav包含vp衣殼多肽,所述vp衣殼多肽包含對應(yīng)于vp1多肽的殘基581至589的581-589區(qū)域,其中所述581-589區(qū)域與seq?id?no:9相比包含至少一個氨基酸取代;用所述raav感染所述受試者的中樞神經(jīng)系統(tǒng)(cns)組織;優(yōu)先將所述有效負(fù)載以是野生型aav5的至少5倍的rna富集轉(zhuǎn)錄至被所述raav感染的所述cns組織;以及在所述cns組織中產(chǎn)生治療效果,從而治療所述疾患。
40、在一些方面,所述dna富集是所述野生型aav5的至少20倍。
41、在各個方面,本公開提供了一種治療受試者的疾患的方法,所述方法包括:向所述受試者施用重組腺相關(guān)病毒(raav),其中所述raav包封有效負(fù)載,并且其中所述raav包含vp衣殼多肽,所述vp衣殼多肽包含對應(yīng)于vp1多肽的殘基581至589的581-589區(qū)域,其中所述581-589區(qū)域具有與以下序列具有至少85%同一性的序列:(a)seq?id?no:18,(b)seq?idno:3472,(c)seq?id?no:262,(d)seq?id?no:3306,(e)seq?id?no:2028,(f)seq?id?no:2791,(g)seq?id?no:424,(h)seq?id?no:2536,(i)seq?id?no:1971,(j)seq?id?no:415,(k)seq?id?no:3846,(l)seq?id?no:3283,(m)seq?id?no:1956,(n)seq?id?no:3297,(o)seq?id?no:4545,(p)seq?id?no:2661,(q)seq?id?no:1576,(r)seq?id?no:425,(s)seq?idno:709,(t)seq?id?no:2168,(u)seq?id?no:54,(v)seq?id?no:429,(w)seq?id?no:708,(x)seq?id?no:428,(y)seq?id?no:4119,(z)seq?id?no:3906,(aa)seq?id?no:2456,(bb)seq?id?no:2278,(cc)seq?id?no:5006,或(dd)seq?id?no:426;用所述raav感染所述受試者的cns組織;將所述有效負(fù)載遞送至被所述raav感染的所述cns組織;以及在所述cns組織中產(chǎn)生治療效果,從而治療所述疾患。
42、在各個方面,本公開提供了一種治療受試者的疾患的方法,所述方法包括:向所述受試者施用重組腺相關(guān)病毒(raav),其中所述raav包封有效負(fù)載,并且其中所述raav包含vp衣殼多肽,所述vp衣殼多肽包含對應(yīng)于vp1多肽的殘基581至589的581-589區(qū)域,其中所述581-589區(qū)域與seq?id?no:1的殘基581至589相比包含至少一個氨基酸取代,并且其中所述vp衣殼多肽不具有seq?id?no:3、seq?id?no:4、seq?id?no:5、seq?id?no:6、seq?id?no:7或seq?id?no:8中的任一者的序列;用與包含seq?id?no:1的肽的野生型aav5衣殼相比具有至少3倍的cns組織向性的所述raav感染所述受試者的cns組織;將所述有效負(fù)載遞送至被所述raav感染的所述cns組織;以及在所述cns組織中產(chǎn)生治療效果,從而治療所述疾患。
43、在各個方面,本公開提供了一種治療受試者的疾患的方法,所述方法包括:向所述受試者施用重組腺相關(guān)病毒(raav),其中所述raav包封有效負(fù)載,并且其中所述raav包含如本文所述的vp衣殼多肽;用所述raav感染所述受試者的cns組織;將所述有效負(fù)載遞送至被所述raav感染的所述cns組織;以及在所述cns組織中產(chǎn)生治療效果,從而治療所述疾患。
44、在一些方面,所述疾患是神經(jīng)疾患。在一些方面,所述神經(jīng)疾患是芳族l-氨基酸脫羧酶(aadc)缺乏癥、阿爾茨海默病(alzheimer’sdisease)、tau蛋白病、突觸核蛋白病、巴藤病(batten?disease)、iii型黏多糖病、額顳癡呆、帕金森病(parkinson’s?disease)、皮質(zhì)基底節(jié)變性、進(jìn)行性核上性麻痹、慢性創(chuàng)傷性腦病、戈謝病(gaucher?disease)、卡納萬病(canavan?disease)、泰伊-薩克斯二氏病(tay-sachs?disease)、亨廷頓病(huntington’sdisease)、普羅托克-羅普斯基綜合征(protocki-lupski?syndrome)、肌萎縮性側(cè)索硬化、唐氏綜合征(down?syndrome)、a型山菲利普病(sanfilippo?disease?type?a)、b型山菲利普病或瑞特綜合征(rett?syndrome)。在一些方面,所述疾患是瑞特綜合征。在一些方面,所述有效負(fù)載編碼靶向由mecp2編碼的mrna的指導(dǎo)rna或靶向mecp2中的過早終止密碼子的trna。在一些方面,所述疾患是帕金森病。在一些方面,所述有效負(fù)載編碼指導(dǎo)rna,所述指導(dǎo)rna靶向編碼lrrk2、gba、α-突觸核蛋白、aadc、gdnf、神經(jīng)秩蛋白(neurturin)、gad、foxg1、kv7.2、脆性x智力低下蛋白、tau或laforin的mrna。在一些方面,所述疾患是阿爾茨海默病。在一些方面,所述有效負(fù)載編碼指導(dǎo)rna,所述指導(dǎo)rna靶向編碼淀粉樣前體蛋白(app)、α-突觸核蛋白(snca)、tau蛋白(mapt)或載脂蛋白e(apoe)的mrna。在一些方面,所述有效負(fù)載編碼轉(zhuǎn)基因,所述轉(zhuǎn)基因編碼淀粉樣前體蛋白(app)、α-突觸核蛋白(snca)、tau蛋白(mapt)或載脂蛋白e(apoe)。
45、在一些方面,所述方法包括每kg受試者體重施用1×105至5×1014個raav。在一些方面,所述方法包括用是包含seq?id?no:1的肽的野生型aav5衣殼的至少2.5倍、至少3倍、至少3.5倍、至少4倍、至少5倍、至少10倍、至少20倍、至少50倍、至少75倍、至少100倍、至少200倍、至少500倍或至少1000倍的組織向性來感染所述cns組織。
46、在一些方面,所述有效負(fù)載編碼治療性蛋白質(zhì)、治療性多核苷酸、指導(dǎo)rna、trna、阻抑trna、sirna、mirna、mrna、shrna、環(huán)狀rna、反義寡核苷酸(aso)、核酶、dna酶、適體或它們的任何組合。在一些方面,所述指導(dǎo)rna是crispr/cas指導(dǎo)rna或adar指導(dǎo)rna。在一些方面,所述治療性蛋白質(zhì)選自由以下組成的組:芳族l-氨基酸脫羧酶(aadc)、淀粉樣前體蛋白(app)、α-突觸核蛋白、微管相關(guān)蛋白tau(mapt)、apoe、神經(jīng)生長因子(ngf)、端粒酶逆轉(zhuǎn)錄酶(tert)、cln2、cln3、cln6、n-乙?;?α-氨基葡萄糖苷酶(naglu)、顆粒體蛋白、葡糖神經(jīng)酰胺酶β(gba)、天冬氨酸?;?、gdnf、神經(jīng)秩蛋白(ntn)、谷氨酸脫羧酶(gad)、foxg1、kv7.2、laforin、富亮氨酸重復(fù)激酶2(lrrk2)、己糖胺酶a(hexa)、己糖胺酶b(hexb)、亨廷頓蛋白(huntingtin)、膽固醇24-羥化酶、c9orf72、超氧化物歧化酶1(sod1)、雙特異性酪氨酸磷酸化調(diào)節(jié)激酶1a(dyrka1)、n-磺基葡糖胺磺基水解酶(sgsh)、過量基因座蛋白1(surf1)、gaba轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白1(gat1)和甲基-cpg結(jié)合蛋白2(mecp2)。在一些方面,所述治療性多核苷酸靶向編碼選自由以下組成的組的蛋白質(zhì)的mrna:芳族l-氨基酸脫羧酶(aadc)、淀粉樣前體蛋白(app)、α-突觸核蛋白、微管相關(guān)蛋白tau(mapt)、apoe、神經(jīng)生長因子(ngf)、端粒酶逆轉(zhuǎn)錄酶(tert)、cln2、cln3、cln6、n-乙?;?α-氨基葡萄糖苷酶(naglu)、顆粒體蛋白、葡糖神經(jīng)酰胺酶β(gba)、天冬氨酸酰化酶、gdnf、神經(jīng)秩蛋白(ntn)、谷氨酸脫羧酶(gad)、foxg1、kv7.2、laforin、富亮氨酸重復(fù)激酶2(lrrk2)、己糖胺酶a(hexa)、己糖胺酶b(hexb)、亨廷頓蛋白(huntingtin)、膽固醇24-羥化酶、c9orf72、超氧化物歧化酶1(sod1)、雙特異性酪氨酸磷酸化調(diào)節(jié)激酶1a(dyrka1)、n-磺基葡糖胺磺基水解酶(sgsh)、過量基因座蛋白1(surf1)、gaba轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白1(gat1)和甲基-cpg結(jié)合蛋白2(mecp2)。在一些方面,所述有效負(fù)載編碼crispr/cas系統(tǒng)的組分、作用于rna(adar)酶的腺苷脫氨酶、轉(zhuǎn)錄活化子或轉(zhuǎn)錄抑制子。在一些方面,所述crispr/cas系統(tǒng)的組分包括cas3、cas8、cas10、cas9、cas4、cas12、cas13、指導(dǎo)rna或它們的組合。在一些方面,所述adar酶是adar1或adar2。在一些方面,所述轉(zhuǎn)錄活化子是vp64。在一些方面,所述轉(zhuǎn)錄抑制子是krab。
47、在一些方面,所述方法包括向受試者全身性施用raav。在一些方面,所述方法包括通過靜脈內(nèi)施用、肌內(nèi)施用、腹膜內(nèi)施用或口服施用來施用raav。在一些方面,所述方法還包括在被raav感染的cns組織中表達(dá)由有效負(fù)載編碼的治療性多肽或治療性多核苷酸。在一些方面,所述方法包括表達(dá)與包含seq?id?no:1的肽的野生型aav5衣殼相比具有更高的cns組織向性的治療性多肽或治療性多核苷酸。在一些方面,所述方法包括表達(dá)與野生型aav5衣殼相比具有至少3倍、至少3.5倍、至少4倍、至少5倍、至少10倍、至少20倍、至少50倍、至少75倍、至少100倍、至少200倍、至少500倍或至少1000倍的向性的治療性多肽或治療性多核苷酸。
48、在一些方面,所述方法包括在受試者中產(chǎn)生比全身性施用相當(dāng)數(shù)量的包含seq?idno:1的vp衣殼多肽的野生型aav5衣殼產(chǎn)生的毒性更低的毒性。在一些方面,所述方法包括在受試者中產(chǎn)生比全身性施用一定數(shù)量的足以將相當(dāng)數(shù)量的有效負(fù)載遞送至cns組織的包含seq?id?no:1的vp衣殼多肽的野生型aav5衣殼時產(chǎn)生的毒性更低的毒性。在一些方面,所述方法包括在受試者中產(chǎn)生比全身性施用相當(dāng)數(shù)量的包含seq?id?no:1的vp衣殼多肽的野生型aav5衣殼時產(chǎn)生的中和抗體濃度更低的中和抗體濃度。在一些方面,所述方法包括在受試者中產(chǎn)生比玻璃體內(nèi)施用相當(dāng)數(shù)量的野生型aav2衣殼時產(chǎn)生的中和抗體濃度更低的中和抗體濃度。在一些方面,所述方法包括在受試者中產(chǎn)生的中和抗體的濃度低于玻璃體內(nèi)施用相當(dāng)數(shù)量的野生型aav8衣殼時產(chǎn)生的中和抗體的濃度。在一些方面,所述方法包括在受試者中產(chǎn)生比玻璃體內(nèi)施用相當(dāng)數(shù)量的野生型aav9衣殼時產(chǎn)生的中和抗體濃度更低的中和抗體濃度。在一些方面,所述vp衣殼多肽還包含581-589區(qū)域外的有助于相對于野生型aav衣殼減少中和抗體的產(chǎn)生的一個或多個突變。在一些方面,所述方法包括在受試者中產(chǎn)生比全身性施用一定數(shù)量的足以將相當(dāng)數(shù)量的有效負(fù)載遞送至所述cns組織的包含seqid?no:1的vp衣殼多肽的野生型aav5衣殼時產(chǎn)生的中和抗體濃度更低的中和抗體濃度。
49、在各個方面,本公開提供了一種病毒蛋白(vp)衣殼多肽,其中所述vp衣殼多肽包含對應(yīng)于vp1多肽的殘基581至589的581-589區(qū)域,其中所述581-589區(qū)域與seq?id?no:9相比包含至少一個氨基酸取代,并且其中包含所述vp衣殼多肽的重組病毒衣殼能夠優(yōu)先靶向中樞神經(jīng)系統(tǒng)組織和心肌組織。
50、在一些方面,所述581-589區(qū)域具有與選自由以下組成的組的序列具有至少85%序列同一性的序列:seq?id?no:18、seq?id?no:2536、seq?id?no:3846、seq?id?no:4545、seq?id?no:2661、seq?id?no:1576、seq?id?no:4317、seq?id?no:23、seq?id?no:22、seq?idno:964、seq?id?no:4288、seq?id?no:4338、seq?id?no:5037和seq?id?no:4936。在一些方面,所述581-589區(qū)域具有選自由以下組成的組的序列:seq?id?no:18、seq?id?no:2536、seq?id?no:3846、seq?id?no:4545、seq?id?no:2661、seq?id?no:1576、seq?id?no:4317、seq?id?no:23、seq?id?no:22、seq?id?no:964、seq?id?no:4288、seq?id?no:4338、seq?idno:5037和seq?id?no:4936。
51、在各個方面,本公開提供了一種病毒蛋白(vp)衣殼多肽,其中所述vp衣殼多肽包含對應(yīng)于vp1多肽的殘基581至589的581-589區(qū)域,其中所述581-589區(qū)域與seq?id?no:9相比包含至少一個氨基酸取代,并且其中包含所述vp衣殼多肽的重組病毒衣殼能夠優(yōu)先靶向中樞神經(jīng)系統(tǒng)組織和骨骼肌組織。
52、在一些方面,所述581-589區(qū)域具有與選自由以下組成的組的序列具有至少85%序列同一性的序列:seq?id?no:18、seq?id?no:3472、seq?id?no:262、seq?id?no:3306、seqid?no:2536、seq?id?no:1971、seq?id?no:3283、seq?id?no:3297、seq?id?no:4545、seq?idno:2661、seq?id?no:307、seq?id?no:4317、seq?id?no:1268、seq?id?no:4288、seq?id?no:724和seq?id?no:5037。在一些方面,所述581-589區(qū)域具有選自由以下組成的組的序列:seq?id?no:18、seq?id?no:3472、seq?id?no:262、seq?id?no:3306、seq?id?no:2536、seqid?no:1971、seq?id?no:3283、seq?id?no:3297、seq?id?no:4545、seq?id?no:2661、seq?idno:307、seq?id?no:4317、seq?id?no:1268、seq?id?no:4288、seq?id?no:724和seq?id?no:5037。
53、在各個方面,本公開提供了一種病毒蛋白(vp)衣殼多肽,其中所述vp衣殼多肽包含對應(yīng)于vp1多肽的殘基581至589的581-589區(qū)域,其中所述581-589區(qū)域與seq?id?no:9相比包含至少一個氨基酸取代,并且其中包含所述vp衣殼多肽的重組病毒衣殼能夠優(yōu)先靶向中樞神經(jīng)系統(tǒng)組織和肌肉組織。
54、在一些方面,所述581-589區(qū)域具有與選自由以下組成的組的序列具有至少85%序列同一性的序列:seq?id?no:18、seq?id?no:3472、seq?id?no:262、seq?id?no:2536、seqid?no:3846、seq?id?no:3297、seq?id?no:4545、seq?id?no:2661、seq?id?no:1576、seq?idno:4317、seq?id?no:23、seq?id?no:22、seq?id?no:964、seq?id?no:4288、seq?id?no:4290、seq?id?no:4338和seq?id?no:5037。在一些方面,所述581-589區(qū)域具有選自由以下組成的組的序列:seq?id?no:18、seq?id?no:3472、seq?id?no:262、seq?id?no:2536、seqid?no:3846、seq?id?no:3297、seq?id?no:4545、seq?id?no:2661、seq?id?no:1576、seq?idno:4317、seq?id?no:23、seq?id?no:22、seq?id?no:964、seq?id?no:4288、seq?id?no:4290、seq?id?no:4338和seq?id?no:5037。
55、在各個方面,本公開提供了一種用于治療受試者的疾患的方法中的重組腺相關(guān)病毒(raav),所述方法包括:向所述受試者施用raav,其中所述raav包封有效負(fù)載,并且其中所述raav包含vp衣殼多肽,所述vp衣殼多肽包含對應(yīng)于vp1多肽的殘基581至589的581-589區(qū)域,其中所述581-589區(qū)域與seq?id?no:9相比包含至少一個氨基酸取代;用所述raav感染所述受試者的中樞神經(jīng)系統(tǒng)(cns)組織;以及優(yōu)先將所述有效負(fù)載以是野生型aav9的至少100倍的dna富集遞送至被所述raav感染的所述cns組織。
56、在各個方面,本公開提供了一種用于治療受試者的疾患的方法中的重組腺相關(guān)病毒(raav),所述方法包括:向所述受試者施用raav,其中所述raav包封有效負(fù)載,并且其中所述raav包含vp衣殼多肽,所述vp衣殼多肽包含對應(yīng)于vp1多肽的殘基581至589的581-589區(qū)域,其中所述581-589區(qū)域與seq?id?no:9相比包含至少一個氨基酸取代;用所述raav感染所述受試者的中樞神經(jīng)系統(tǒng)(cns)組織;以及優(yōu)先將所述有效負(fù)載以是野生型aav9的至少100倍的rna富集轉(zhuǎn)錄至被所述raav感染的所述cns組織。
57、在各個方面,本公開提供了一種用于治療受試者的疾患的方法中的重組腺相關(guān)病毒(raav),所述方法包括:向所述受試者施用raav,其中所述raav包封有效負(fù)載,并且其中所述raav包含vp衣殼多肽,所述vp衣殼多肽包含對應(yīng)于vp1多肽的殘基581至589的581-589區(qū)域,其中所述581-589區(qū)域與seq?id?no:9相比包含至少一個氨基酸取代;用所述raav感染所述受試者的中樞神經(jīng)系統(tǒng)(cns)組織;以及優(yōu)先將所述有效負(fù)載以是野生型aav5的至少5倍的dna富集遞送至被所述raav感染的所述cns組織。
58、在各個方面,本公開提供了一種用于治療受試者的疾患的方法中的重組腺相關(guān)病毒(raav),所述方法包括:向所述受試者施用raav,其中所述raav包封有效負(fù)載,并且其中所述raav包含vp衣殼多肽,所述vp衣殼多肽包含對應(yīng)于vp1多肽的殘基581至589的581-589區(qū)域,其中所述581-589區(qū)域與seq?id?no:9相比包含至少一個氨基酸取代;用所述raav感染所述受試者的中樞神經(jīng)系統(tǒng)(cns)組織;以及優(yōu)先將所述有效負(fù)載以是野生型aav5的至少5倍的rna富集轉(zhuǎn)錄至被所述raav感染的所述cns組織。
59、在各個方面,本公開提供了一種用于治療受試者的疾患的方法中的重組腺相關(guān)病毒(raav),所述方法包括:向所述受試者施用raav,其中所述raav包封有效負(fù)載,并且其中所述raav包含vp衣殼多肽,所述vp衣殼多肽包含對應(yīng)于vp1多肽的殘基581至589的581-589區(qū)域,其中所述581-589區(qū)域具有與以下序列具有至少85%同一性的序列:(a)seq?id?no:18,(b)seq?id?no:3472,(c)seq?id?no:262,(d)seq?id?no:3306,(e)seq?id?no:2028,(f)seq?id?no:2791,(g)seq?id?no:424,(h)seq?id?no:2536,(i)seq?id?no:1971,(j)seq?idno:415,(k)seq?id?no:3846,(l)seq?id?no:3283,(m)seq?id?no:1956,(n)seq?id?no:3297,(o)seq?id?no:4545,(p)seq?id?no:2661,(q)seq?id?no:1576,(r)seq?id?no:425,(s)seq?id?no:709,(t)seq?id?no:2168,(u)seq?id?no:54,(v)seq?id?no:429,(w)seq?idno:708,(x)seq?id?no:428,(y)seq?id?no:4119,(z)seq?id?no:3906,(aa)seq?id?no:2456,(bb)seq?id?no:2278,(cc)seq?id?no:5006,或(dd)seq?id?no:426;用所述raav感染所述受試者的cns組織;以及將所述有效負(fù)載遞送至被所述raav感染的所述cns組織。
60、在各個方面,本公開提供了一種用于治療受試者的疾患的方法中的重組腺相關(guān)病毒(raav),所述方法包括:向所述受試者施用raav,其中所述raav包封有效負(fù)載,并且其中所述raav包含vp衣殼多肽,所述vp衣殼多肽包含對應(yīng)于vp1多肽的殘基581至589的581-589區(qū)域,其中所述581-589區(qū)域與seq?id?no:1的殘基581至589相比包含至少一個氨基酸取代,并且其中所述vp衣殼多肽不具有seq?id?no:3、seq?id?no:4、seq?id?no:5、seq?id?no:6、seq?id?no:7或seq?id?no:8中的任一者的序列;用與包含seq?id?no:1的肽的野生型aav5衣殼相比具有至少3倍的cns組織向性的所述raav感染所述受試者的cns組織;以及將所述有效負(fù)載遞送至被所述raav感染的所述cns組織。
61、在各個方面,本公開提供了一種用于治療受試者的疾患的方法中的重組腺相關(guān)病毒(raav),所述方法包括:向所述受試者施用raav,其中所述raav包封有效負(fù)載,并且其中所述raav包含如本文所述的vp衣殼多肽;用所述raav感染所述受試者的cns組織;以及將所述有效負(fù)載遞送至被所述raav感染的所述cns組織。
62、在各個方面,本公開提供了一種病毒蛋白(vp)衣殼多肽,其中所述vp衣殼多肽包含對應(yīng)于vp1多肽的殘基581至589的581-589區(qū)域,其中所述581-589區(qū)域與seq?id?no:9相比包含至少一個氨基酸取代,并且其中包含所述vp衣殼多肽的重組病毒衣殼能夠以是野生型aav9的至少25倍的dna富集優(yōu)先靶向心肌組織。
63、在一些方面,所述581-589區(qū)域具有選自由以下組成的組的序列:seq?id?no:348、seq?id?no:2536、seq?id?no:1576、seq?id?no:4955、seq?id?no:5017、seq?id?no:4349、seq?id?no:4964、seq?id?no:293、seq?id?no:4314、seq?id?no:4995、seq?id?no:4366、seqid?no:4961、seq?id?no:4952、seq?id?no:5075、seq?id?no:4354、seq?id?no:5060、seq?idno:5138、seq?id?no:5206、seq?id?no:4288、seq?id?no:5092、seq?id?no:4059、seq?idno:4295、seq?id?no:5030、seq?id?no:4938、seq?id?no:2661、seq?id?no:5215、seq?idno:4960、seq?id?no:4969、seq?id?no:5023、seq?id?no:4934、seq?id?no:4545、seq?idno:4963、seq?id?no:4363、seq?id?no:5159和seq?id?no:4973。
64、在各個方面,本公開提供了一種病毒蛋白(vp)衣殼多肽,其中所述vp衣殼多肽包含對應(yīng)于vp1多肽的殘基581至589的581-589區(qū)域;其中所述581-589區(qū)域具有與以下序列具有至少85%同一性的序列:(a)seq?id?no:348,(b)seq?id?no:2536,(c)seq?id?no:1576,(d)seq?id?no:4955,(e)seq?id?no:5017,(f)seq?id?no:4349,(g)seq?id?no:4964,(h)seq?id?no:293,(i)seq?id?no:4314,(j)seq?id?no:4995,(k)seq?id?no:4366,(l)seqid?no:4961,(m)seq?id?no:4952,(n)seq?id?no:5075,(o)seq?id?no:4354,(p)seq?idno:5060,(q)seq?id?no:5138,(r)seq?id?no:5206,(s)seq?id?no:4288,(t)seq?id?no:5092,(u)seq?id?no:4059,(v)seq?id?no:4295,(w)seq?id?no:5030,(x)seq?id?no:4938,(y)seq?id?no:2661,(z)seq?id?no:5215,(aa)seq?id?no:4960,(bb)seq?id?no:4969,(cc)seq?id?no:5023,或(dd)seq?id?no:4934。
65、在各個方面,本公開提供了一種病毒蛋白(vp)衣殼多肽,其中所述vp衣殼多肽包含對應(yīng)于vp1多肽的殘基581至589的581-589區(qū)域,其中所述581-589區(qū)域與seq?id?no:9相比包含至少一個氨基酸取代,并且其中包含所述vp衣殼多肽的重組病毒衣殼能夠以是野生型aav9的至少15倍的dna富集優(yōu)先靶向骨骼肌組織。
66、在一些方面,所述581-589區(qū)域具有選自由以下組成的組的序列:seq?id?no:3472、seq?id?no:3297、seq?id?no:2661、seq?id?no:4545、seq?id?no:348、seq?id?no:18、seq?id?no:4349、seq?id?no:293、seq?id?no:5017、seq?id?no:4955、seq?id?no:4366、seqid?no:5092、seq?id?no:210、seq?id?no:4059、seq?id?no:2536、seq?id?no:5206和seq?idno:1971。
67、在各個方面,本公開提供了一種病毒蛋白(vp)衣殼多肽,其中所述vp衣殼多肽包含對應(yīng)于vp1多肽的殘基581至589的581-589區(qū)域;其中所述581-589區(qū)域具有與以下序列具有至少85%同一性的序列:(a)seq?id?no:3472,(b)seq?id?no:3297,(c)seq?id?no:2661,(d)seq?id?no:4545,(e)seq?id?no:348,(f)seq?id?no:18,(g)seq?id?no:4349,(h)seq?id?no:293,(i)seq?id?no:5017,(j)seq?id?no:4955,(k)seq?id?no:4366,(l)seq?idno:5092,(m)seq?id?no:210,(n)seq?id?no:4059,(o)seq?id?no:2536,(p)seq?id?no:5206,(q)seq?id?no:1971,(r)seq?id?no:262,(s)seq?id?no:4343,(t)seq?id?no:4995,(u)seq?id?no:4009,(v)seq?id?no:5190,(w)seq?id?no:724,(x)seq?id?no:4288,(y)seqid?no:4973,(z)seq?id?no:4314,(aa)seq?id?no:1561,(bb)seq?id?no:5147,(cc)seq?idno:4238,或(dd)seq?id?no:4961。
68、在各個方面,本公開提供了一種病毒蛋白(vp)衣殼多肽,其中所述vp衣殼多肽包含對應(yīng)于vp1多肽的殘基581至589的581-589區(qū)域,其中所述581-589區(qū)域與seq?id?no:9相比包含至少一個氨基酸取代,并且其中包含所述vp衣殼多肽的重組病毒衣殼能夠以是野生型aav9的至少20倍的dna富集優(yōu)先靶向肌肉組織。
69、在一些方面,所述581-589區(qū)域具有選自由以下組成的組的序列:seq?id?no:348、seq?id?no:2536、seq?id?no:4955、seq?id?no:5017、seq?id?no:4349、seq?id?no:293、seqid?no:1576、seq?id?no:2661、seq?id?no:4964、seq?id?no:4314、seq?id?no:4995、seq?idno:4366、seq?id?no:4545、seq?id?no:4961、seq?id?no:5206、seq?id?no:5092、seq?idno:3472、seq?id?no:5075、seq?id?no:4059、seq?id?no:4354、seq?id?no:5060、seq?idno:4288、seq?id?no:4952、seq?id?no:5138、seq?id?no:18、seq?id?no:5030、seq?id?no:3297、seq?id?no:4295、seq?id?no:4363、seq?id?no:4963、seq?id?no:4973、seq?id?no:5159、seq?id?no:4960、seq?id?no:4938、seq?id?no:5157、seq?id?no:5023和seq?id?no:4969。
70、在各個方面,本公開提供了一種病毒蛋白(vp)衣殼多肽,其中所述vp衣殼多肽包含對應(yīng)于vp1多肽的殘基581至589的581-589區(qū)域;其中所述581-589區(qū)域具有與以下序列具有至少85%同一性的序列:(a)seq?id?no:348,(b)seq?id?no:2536,(c)seq?id?no:4955,(d)seq?id?no:5017,(e)seq?id?no:4349,(f)seq?id?no:293,(g)seq?id?no:1576,(h)seq?id?no:2661,(i)seq?id?no:4964,(j)seq?id?no:4314,(k)seq?id?no:4995,(l)seq?id?no:4366,(m)seq?id?no:4545,(n)seq?id?no:4961,(o)seq?id?no:5206,(p)seqid?no:5092,(q)seq?id?no:3472,(r)seq?id?no:5075,(s)seq?id?no:4059,(t)seq?idno:4354,(u)seq?id?no:5060,(v)seq?id?no:4288,(w)seq?id?no:4952,(x)seq?id?no:5138,(y)seq?id?no:18,(z)seq?id?no:5030,(aa)seq?id?no:3297,(bb)seq?id?no:4295,(cc)seq?id?no:4363,或(dd)seq?id?no:4963。
71、在各個方面,本公開提供了一種病毒蛋白(vp)衣殼多肽,其中所述vp衣殼多肽包含對應(yīng)于vp1多肽的殘基581至589的581-589區(qū)域,其中所述581-589區(qū)域包含與seq?idno:4238-seq?id?no:4933或seq?id?no:4934-seq?id?no:5233中的任一者具有至少85%同一性的序列。
72、在一些方面,所述581-589區(qū)域具有seq?id?no:4238-seq?id?no:4933或seq?idno:4934-seq?id?no:5233中的任一者的序列。
73、通過引用并入
74、本文引用的所有參考文獻(xiàn)都通過引用并入,其程度如同每個單獨(dú)的出版物、數(shù)據(jù)庫條目(例如,genbank序列或geneid條目)、專利申請或?qū)@急痪唧w且單獨(dú)地指示為出于所有目的通過引用整體并入一般。根據(jù)37c.f.r.§1.57(b)(1),通過引用并入的陳述旨在由申請人涉及每一和每個單獨(dú)的出版物、數(shù)據(jù)庫條目(例如,genbank序列或geneid條目)、專利申請或?qū)@?,其中的每一者都按?7c.f.r.§1.57(b)(2)進(jìn)行了明確的標(biāo)識,即使這樣的引用并不緊鄰?fù)ㄟ^引用并入的專用陳述。在說明書中包含通過引用并入的專用陳述(如果有的話)并不以任何方式削弱通過引用并入的一般陳述。本文引用的參考文獻(xiàn)并不旨在承認(rèn)所述參考文獻(xiàn)是相關(guān)的現(xiàn)有技術(shù),也不構(gòu)成對這些出版物或文獻(xiàn)的內(nèi)容或日期的任何承認(rèn)。