本發(fā)明涉及分子生物學,尤其涉及啟動子及其在構(gòu)建產(chǎn)麥角甾醇的酵母菌株中的應用。
背景技術(shù):
1、啟動子(promoters)是dna分子上一段特定的核苷酸序列,它位于結(jié)構(gòu)基因5'端上游的dna序列,能活化rna聚合酶,使之與模板dna準確的結(jié)合并具有轉(zhuǎn)錄起始的特異性。啟動子通過與特定的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合,形成轉(zhuǎn)錄復合物,進而啟動rna聚合酶在dna模板上的移動,從而開始轉(zhuǎn)錄過程。在基因表達過程中,啟動子起著至關(guān)重要的作用,它決定了基因轉(zhuǎn)錄的起始點,并影響著轉(zhuǎn)錄的效率。不同的基因可能具有不同的啟動子序列,不同物種的同工酶的啟動子序列也存在差異,這些序列的差異會導致基因表達的特異性和調(diào)控的復雜性。
2、酵母作為一種廣泛使用的模式生物,在基因表達與產(chǎn)物收獲方面展現(xiàn)了巨大的潛力。其優(yōu)點在于生長迅速、易于培養(yǎng),并且具有相對簡單的基因組結(jié)構(gòu),這使得酵母成為基因工程的理想宿主。通過基因工程技術(shù),科學家可以將目的基因插入酵母的基因組中,實現(xiàn)外源基因的高效表達。同時,酵母細胞內(nèi)的代謝途徑清晰,可以通過代謝工程進一步優(yōu)化基因表達過程,提高目標產(chǎn)物的產(chǎn)量和純度。此外,酵母細胞還能對特定的環(huán)境條件作出響應,如通過調(diào)整溫度、ph值或添加誘導劑等方式,觸發(fā)特定基因的表達,從而實現(xiàn)對產(chǎn)物表達的精確控制。
3、目前,酵母作為一種模式生物,在基因表達與產(chǎn)物收獲領(lǐng)域具有廣泛的應用前景。然而,傳統(tǒng)的酵母啟動子在實際應用中往往會遇到表達效率不足或產(chǎn)物產(chǎn)量較低的問題。為了解決這一難題,研究者們開始對酵母啟動子進行優(yōu)化。啟動子優(yōu)化的方法包括改變啟動子序列的堿基組成、增加或刪除特定的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點、調(diào)整啟動子與基因之間的距離等。通過這些策略,研究者們可以有效地提高啟動子的轉(zhuǎn)錄活性,從而增加目的基因的表達效率,進一步提升產(chǎn)物的產(chǎn)量。當前,針對釀酒酵母的啟動子尚有較大的優(yōu)化空間。
技術(shù)實現(xiàn)思路
1、有鑒于此,本發(fā)明要解決的技術(shù)問題在于提供啟動子及其在構(gòu)建產(chǎn)麥角甾醇的酵母菌株中的應用,以期提高釀酒酵母工程菌株的次生代謝產(chǎn)物的產(chǎn)量,特別是麥角甾醇的產(chǎn)量。
2、本發(fā)明提供的啟動子包括片段a和片段b;
3、所述片段a具有如seq?id?no:1所示的核酸序列;
4、所述片段b具有如seq?id?no:2~9至少一項所示的核酸序列。
5、本發(fā)明對酵母菌,特別是釀酒酵母的啟動子進行改造,在野生型啟動子(seq?idno:1所示)的基礎(chǔ)上添加另一啟動子形成啟動子。本發(fā)明對片段a和片段b的連接關(guān)系不做限定,例如,片段a可在n端也可以在n端。
6、一些實施例中,片段a位于啟動子的n端。
7、一些實施例中,片段b為來源不同的啟動子,與片段a連接形成的新的啟動子的核酸序列如seq?id?no:10~17中任一項所示?;蛘呔唧w在如前所述的片段中取代、缺失或添加一個或多個核苷酸的核酸;或者與如前所述的核酸序列具有至少90%同一性。
8、實驗表明,相對于野生型啟動子而言,seq?id?no:10~17中任一項所示的啟動子都能夠提高麥角甾醇的產(chǎn)量,其中,seq?id?no:10、seq?id?no:11、seq?id?no:13或seq?idno:14所示的啟動子促進麥角甾醇產(chǎn)量的效果與野生型相比存在顯著性差異(p<0.05)。其中,seq?id?no:11所示的啟動子在提高麥角甾醇產(chǎn)量方面存在更顯著的效果(p<0.01)。此外,相對于野生型啟動子而言,本發(fā)明提供的啟動子還能夠降低雜質(zhì)的占比,特別是seq?idno:11所示的啟動子,相對于野生型啟動子能夠極顯著降低雜質(zhì)的含量(p<0.001)。
9、本發(fā)明還提供了如前所述啟動子在提高酵母基因表達水平中的應用。
10、本發(fā)明中,所述酵母為釀酒酵母、假絲酵母、球擬酵母、紅酵母、耶氏酵母、漢遜酵母、畢赤酵母或克魯維酵母。
11、進一步的,本發(fā)明還提供了表達單元,其包括如前所述的啟動子和目的基因。
12、本發(fā)明中,所述目的基因為erg4基因、erg2基因或erg3基因。
13、作為可行性案例,所述表達單元中還包括終止子,所述終止子為終止子tadh1、終止子tpdc1或具有seq?id?no:18?所示核酸序列的終止子。
14、另一些可行案例中,所述表達單元中,還包括增強子、轉(zhuǎn)座子或側(cè)翼序列中的至少一種。
15、更進一步的,本發(fā)明還提供了一種質(zhì)粒載體,其包括如前所述的啟動子或包括如前所述的表達單元。
16、本發(fā)明中,所述質(zhì)粒載體為穿梭載體,或酵母表達載體。本發(fā)明對此不做限定。作為舉例,所述質(zhì)粒載體的骨架為pscm-n20質(zhì)粒和/或phcas9質(zhì)粒。
17、更進一步的,本發(fā)明還提供了一種酵母工程菌,其包括如前所述的質(zhì)粒載體,或基因組中整合有如前所述的啟動子或包括如前所述的表達單元。
18、一些實施例中,本發(fā)明所述的酵母工程菌的底盤菌為cctcc?no:?m2016418,其erg4基因的啟動子為如前所述的啟動子。
19、更進一步的,本發(fā)明還提供了一種麥角甾醇的制備方法,其包括,培養(yǎng)如前所述的酵母工程菌,獲得含有麥角甾醇的發(fā)酵產(chǎn)物。
20、本發(fā)明中,所述含有麥角甾醇的發(fā)酵產(chǎn)物是發(fā)酵后的菌液、經(jīng)分離的上清液或濕酵母。本發(fā)明中,所述麥角甾醇的制備還包括將濕酵母與片堿、氯化鈉和無水乙醇混合,經(jīng)90℃處理8h后,用正已烷進行萃取,經(jīng)洗滌、濃縮后結(jié)晶獲得麥角甾醇。
21、本發(fā)明對酵母菌,特別是釀酒酵母的啟動子進行改造,在野生型啟動子(seq?idno:1所示)的基礎(chǔ)上添加另一啟動子形成新的啟動子。含有該啟動子添加在erg4基因的起始位置上,構(gòu)建獲得的產(chǎn)麥角甾醇的釀酒酵母菌株,麥角甾醇含量可達3.0~3.3?mg/g?dcw,產(chǎn)量提升150%左右;甾醇類雜質(zhì)占比為6.675%,比野生型菌株雜質(zhì)占比下降50%左右。
1.啟動子,其核酸序列如seq?id?no:11所示。
2.權(quán)利要求1所述的啟動子在提高酵母基因表達水平中的應用。
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的應用,其特征在于,所述基因為erg4基因,所述酵母為釀酒酵母。
4.表達單元,其包括權(quán)利要求1所述的啟動子和目的基因。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的表達單元,其特征在于,所述目的基因為erg4基因。
6.根據(jù)權(quán)利要求4或5所述的表達單元,其特征在于,所述表達單元中還包括終止子,所述終止子的核酸序列如seq?id?no:18所示。
7.質(zhì)粒載體,其包括權(quán)利要求1所述的啟動子或包括權(quán)利要求4~6任一項所述的表達單元。
8.酵母工程菌,其包括權(quán)利要求7所述的質(zhì)粒載體,或基因組中整合有權(quán)利要求1所述的啟動子或包括權(quán)利要求4~6任一項所述的表達單元。
9.根據(jù)權(quán)利要求8所述的酵母工程菌,其特征在于,其底盤菌為cctcc?no:?m2016418,其erg4基因的啟動子為權(quán)利要求1所述的啟動子。
10.麥角甾醇的制備方法,其包括,培養(yǎng)權(quán)利要求8或9所述的酵母工程菌,獲得含有麥角甾醇的發(fā)酵產(chǎn)物。